/
/
Kernisolatie van vers bevroren hersentumoren voor single-nucleus RNA-seq en ATAC-seq
È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo. Accedi o inizia la tua prova gratuita.
1Neurology Clinic and National Center for Tumor Diseases,University Hospital Heidelberg, 2Bioinformatics and Omics Data Analytics,German Cancer Research Center (DKFZ), 3Clinical Cooperation Unit Neurooncology,German Cancer Research Center (DKFZ), 4Division of Experimental Neurosurgery, Department of Neurosurgery,University of Heidelberg, INF 400, Heidelberg, Germany
Capitoli
- 00:04Introduction
- 01:01Tissue Dissection and Dissociation
- 03:20Gradient Centrifugation and Isolation of Nuclei
- 04:56Results: Comparison of UMIs and Genes Obtained from Different Human Brain snRNA-seq Datasets
- 05:57Conclusion
Intratumorale heterogeniteit is een inherent kenmerk van tumoren, waaronder gliomen. We ontwikkelden een eenvoudig en efficiënt protocol dat een combinatie van buffers en gradiëntcentrifugatie gebruikt om enkele kernen te isoleren uit vers bevroren glioomweefsels voor single nucleus RNA en ATAC-sequencingstudies.
