Genetic Variant Detection in the <em>CALR</em> gene using High Resolution Melting Analysis

Tadej Paji&#269;; Tanja Bel&#269;i&#269; Miki&#269;; Helena Podgornik; Jurka Klun; Sandra &#352;u&#263;urovi&#263;; Samo Zver; Matjaz Sever

doi:10.3791/61642

Journal

/

Genetics

/

Detectie van genetische varianten in het CALR-gen met behulp van smeltanalyse met hoge resolutie

JoVE Journal
Genetics

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Genetics

Genetic Variant Detection in the CALR gene using High Resolution Melting Analysis

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Detectie van genetische varianten in het CALR-gen met behulp van smeltanalyse met hoge resolutie

DOI:

10.3791/61642-v

•

08:46 min

•

August 26, 2020

•

Tadej Pajič², Tanja Belčič Mikič, Helena Podgornik³, Jurka Klun, Sandra Šućurović, Samo Zver, Matjaz Sever

¹Department of Hematology,University Medical Centre Ljubljana, ²Clinical Institute for Genomic Medicine,University Medical Centre Ljubljana, ³Faculty of Pharmacy,University of Ljubljana

Chapters

00:04Introduction
01:02Fluorescence-based Quantitative Real-time PCR (qPCR) and Post-qPCR Analysis by HRM
05:32Agarose Gel Electrophoresis
06:50Results: Detection of the Genetic Variants in the CALR Gene
08:21Conclusion

Summary

Automatic Translation

Hoge resolutie smeltanalyse (HRM) is een gevoelige en snelle oplossing voor detectie van genetische varianten. Het hangt af van sequentieverschillen die ertoe leiden dat heteroduplexen de vorm van de smeltcurve veranderen. Door hrm en agarose gel elektroforese te kammen, kunnen verschillende soorten genetische varianten zoals indels worden geïdentificeerd.

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Detectie van Copy Number Wijzigingen met behulp van Single Cell Sequencing

Hoge resolutie smeltende PCR voor Complement Receptor 1 Lengte Polymorfisme Genotypering: Een Innovatief Gereedschap voor Alzheimer's Ziekte Geneesbaarheid Beoordeling

Hoge resolutie fluorescentie In Situ hybridisatie in Drosophila embryo's en weefsels met behulp van Tyramide signaal versterking

Promotor Capture Hi-C: High-resolution, genoom-brede profilering van promotor interacties

Hoge resolutie vergelijking van bacteriële vervoeging frequenties

High-throughput identificatie van regelgevende gensequenties met behulp van Next-generation Sequencing van circulaire chromosoom conformatie Capture (4C-seq)

Bepaling van de waarschijnlijkheid van Variant pathogeniteit met behulp van aminozuur-niveau Signal-to-Noise analyse van genetische variatie

Een bioinformatica-pijpleiding om de MicroRNA Transcriptomes in fabrieken nauwkeurig en efficiënt te analyseren

Identificeren van mutaties door een hoge resolutie smelting in een TILLING populatie van rijst

Hoge resolutie mapping van eiwit-DNA interacties in muis stamcel-afgeleide neuronen met behulp van chromatine immunoprecipitation-exonuclease (ChIP-Exo)