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基于多重 CRISPR 增强器的细胞系干扰增强功能解剖

JoVE 신문
유전학

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Dissection of Enhancer Function Using Multiplex CRISPR-based Enhancer Interference in Cell Lines

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基于多重 CRISPR 增强器的细胞系干扰增强功能解剖

DOI:

10.3791/57883-v

•

10:46 min

•

June 02, 2018

•

Julia B. Carleton, Kristofer C. Berrett, Jason Gertz

¹Department of Oncological Sciences, Huntsman Cancer Institute,University of Utah

Chapters

00:05Title
00:37Guide RNA Design
03:37Guide RNA Cloning
06:27Transfection of Enhancer-I, Cell Harvest, and RNA Extraction
08:21Results: Guide RNA Design/Cloning and Evaluation of Gene Expression in Response to Enhancer-i
09:23Conclusion

Summary

자동 번역

本协议描述了设计和执行多路化增强剂的步骤, 该方法与停用融合蛋白 SID4X-dCas9-KRAB (即增强器干扰) 相结合。该协议能够识别出调节基因表达的增强剂, 并促进调节共同靶基因的促促剂之间的关系的解剖。

Tags

CRISPR Enhancer Interference Gene Regulation Transcription Guide RNA Design E-CRISP UCSC Genome Browser BLAT Genome Assembly Off-target Protospacer-adjacent Motif Genomics

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