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Dissection de la fonction de Enhancer utilisant le Multiplex Enhancer CRISPR axée sur les interférences dans les lignées cellulaires
JoVE 신문
유전학
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JoVE 신문 유전학
Dissection of Enhancer Function Using Multiplex CRISPR-based Enhancer Interference in Cell Lines
DOI:

10:46 min

June 02, 2018

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Chapters

  • 00:05Title
  • 00:37Guide RNA Design
  • 03:37Guide RNA Cloning
  • 06:27Transfection of Enhancer-I, Cell Harvest, and RNA Extraction
  • 08:21Results: Guide RNA Design/Cloning and Evaluation of Gene Expression in Response to Enhancer-i
  • 09:23Conclusion

Summary

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Ce protocole décrit les étapes nécessaires pour concevoir et effectuer le ciblage multiplexé des rehausseurs avec la protéine de fusion désactivant SID4X-dCas9-KRAB, également connu sous le nom des interférences enhancer (Enhancer-i). Ce protocole permet l’identification des activateurs qui régulent l’expression des gènes et facilite la dissection des relations entre les exhausteurs de réglementer un gène cible commun.

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