Summary

遺伝子治療アプリケーションのための造血幹細胞および前駆細胞のCRISPR/Cas9遺伝子編集

Published: August 09, 2022
doi:

Summary

本プロトコルは、 in vivoでの遺伝子編集細胞の堅牢な生着のために最適化された造血幹および前駆細胞(HSPC)培養手順を記載しています。

Abstract

CRISPR/Cas9は、さまざまな遺伝子変異を修正するために広く採用されている、汎用性が高く効率的な遺伝子編集ツールです。造血幹および前駆細胞(HSPC)のin vitro での遺伝子操作の実現可能性により、HSPCは遺伝子治療の理想的な標的細胞になります。しかし、HSPCは、 ex vivo 培養において生着および多系統再増殖の可能性を適度に失う。本研究では、HSPCの生着を改善し、 in vivoで遺伝子改変細胞の数を増加させる理想的な培養条件について説明します。現在のレポートには、培地の種類、独自の低分子カクテルの補給、サイトカイン濃度、細胞培養プレート、培養密度など、最適化された in vitro 培養条件が表示されます。それに加えて、最適化されたHSPC遺伝子編集手順と、遺伝子編集イベントの検証が提供されます。 in vivo 検証のために、マウスレシピエントにおける遺伝子編集HSPC注入および生着後分析が表示されます。結果は、培養系がin vitroで機能的な造血幹細胞の頻度を増加させ、その結果 、in vivoで遺伝子編集細胞の強力な生着をもたらすことを実証しました。

Introduction

同種異系移植環境におけるヒト白血球抗原(HLA)マッチングドナーへのアクセスの難しさと、汎用性が高く安全な遺伝子工学ツールの急速な開発により、自家造血幹細胞移植(HSCT)は遺伝性血液疾患の治癒的治療戦略となっています1,2。自家造血幹および前駆細胞(HSPC)遺伝子治療には、患者のHSPCの収集、遺伝子操作、疾患の原因となる突然変異の修正、および遺伝子修正されたHSPCの患者への移植が含まれます3,4。ただし、遺伝子治療の成功結果は、移植可能な遺伝子改変移植片の品質に依存しています。HSPCの遺伝子操作ステップとエクスビボ培養は、長期造血幹細胞(LT-HSC)の頻度を低下させることにより移植片の品質に影響を与え、大量の遺伝子操作HSPCの注入を必要とします2,5,6

SR1およびUM171を含むいくつかの低分子は、現在、臍帯血HSPCを堅牢に拡張するために使用されています7,8。成人HSPCの場合、動員で得られる細胞収量が高いため、堅牢な拡張は必要ありません。しかし、分離されたHSPCの幹細胞性をex vivo培養で保持することは、その遺伝子治療アプリケーションにとって非常に重要です。そこで、レスベラトロール、UM729、SR1(RUS)7の低分子を組み合わせて造血幹細胞(HSC)の培養濃縮に焦点を当てたアプローチを開発しています。最適化されたHSPC培養条件は、造血幹細胞の濃縮を促進し、その結果、in vivoでの遺伝子改変造血幹細胞の頻度が増加し、大量のHSPCを遺伝子操作する必要性を減らし、費用対効果の高い遺伝子治療アプローチを促進します8

ここでは、HSPC培養のための包括的なプロトコルを、 in vivoでの遺伝子編集細胞の注入と分析とともに説明します。

Protocol

免疫不全マウスでのin vivo実験は、インドのベロールにあるクリスチャン医科大学の研究所動物倫理委員会(IAEC)によって承認され、それに従って実施されました。顆粒球コロニー刺激因子(G-CSF)に動員された末梢血サンプルは、治験審査委員会(IRB)の承認を得た後、インフォームドコンセントで健康なヒトドナーから収集されました。 1.末梢血単核球(PBMNC)の単離?…

Representative Results

本研究では、エクスビボ培養におけるCD34 + CD133 + CD90 + HSCの保持を促進する理想的なHSPC培養条件を特定します。遺伝子改変造血幹細胞の増強とともに造血幹細胞の培養濃縮を実証するために、PBMNC単離、CD34+細胞精製、培養、遺伝子編集、移植、生着の特性評価、およびin vivoでの遺伝子改変細胞のための最適化された手順が提供されています(<stron…

Discussion

HSPC遺伝子治療の成功は、主に移植片中の生着可能な造血幹細胞の質と量に依存しています。ただし、HSCの機能特性は、遺伝子操作手順に関連するin vitro培養や毒性など、遺伝子治療製品の準備段階で大きな影響を受けます。これらの制限を克服するために、エクスビボ培養でCD34 + CD133 + CD90 + HSCのステム性を保持する理想的なHSPC培養条件を特定しました?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

著者らは、CSCRのフローサイトメトリー施設および動物施設のスタッフに感謝したい。A.C.はICMR-SRFフェローシップ、K.V.K.はDST-INSPIREフェローシップ、P.B.はCSIR-JRFフェローシップから資金提供を受けていますこの研究は、インド政府のバイオテクノロジー省によって資金提供されました(助成金番号BT / PR26901 / MED/ 31/377 / 2017およびBT / PR31616 / MED/ 31/408/2019)

Materials

4D-Nucleofector® X Unit LONZA BIOSCIENCE AAF-1003X
4D-Nucleofector™ X Kit ( 16-well Nucleocuvette™ Strips) LONZA BIOSCIENCE V4XP-3032
Antibiotic-Antimycotic (100X) THERMO SCIENTIFIC 15240096
Anti-human CD45 APC BD BIOSCIENCE  555485 
Anti-human CD13 PE BD BIOSCIENCE 555394
Anti-human CD19 PerCP BD BIOSCIENCE 340421
Anti-human CD3 PE-Cy7 BD BIOSCIENCE 557749
Anti-human CD90 APC BD BIOSCIENCE 561971
Anti-human CD133/1  Miltenyibiotec 130-113-673
Anti-human CD34 PE BD BIOSCIENCE 348057
Anti-mouse CD45.1 PerCP-Cy5 BD BIOSCIENCE 560580
Blood Irradator-2000  BRIT (Department of Biotechnology, India) BI 2000 
Cell culture dish (delta surface-treated 6-well plates) NUNC (THERMO SCIENTIFIC) 140675
CrysoStor CS10 BioLife solutions #07952
Busulfan CELON LABS (60mg/10mL)
Guide-it Recombinant Cas9 TAKARA BIO 632640
Cas9-eGFP SIGMA C120040 
 Centrifuge tube-15ml CORNING 430790
 Centrifuge tube-50ml NUNC (THERMO SCIENTIFIC) 339652
DMSO MPBIO 219605590
DNAase STEMCELL TECHNOLOGIES 6469
Dulbecco′s Phosphate Buffered Saline- 1X HYCLONE SH30028.02
EasySep™ Human CD34 Positive Selection Kit II STEMCELL TECHNOLOGIES 17856
EasySep magnet STEMCELL TECHNOLOGIES 18000
Electrophoresis unit ORANGE INDIA HDS0036
FBS THERMO SCIENTIFIC 10270106
Flow cytometer – ARIA III BD BIOSCIENCE
FlowJo  BD BIOSCIENCE  -
Flt3-L PEPROTECH 300-19-1000
Gel imaging system CELL BIOSCIENCES 11630453
HighPrep DTR reagent MAGBIOGENOMICS DT-70005
Human BD Fc Block BD BIOSCIENCE 553141
IL6 PEPROTECH 200-06-50
IMDM media THERMO SCIENTIFIC 12440053
Infrared lamp MURPHY
Insulin syringe 6mm 31G BD BIOSCIENCE 324903
Ketamine KETMIN 50
Loading dye 6X TAKARA BIO 9156
Lymphoprep STEMCELL TECHNOLOGIES 7851
Mice Restrainer AVANTOR TV-150
Nano drop spectrophotometer THERMO SCIENTIFIC ND-2000C
Neubauer cell counting chamber ROHEM INSTRUMENTS CC-3073
NOD.Cg-Prkdcscid Il2rgtm1Wjl/SzJ (NSG) The Jackson Laboratory RRID:IMSR_JAX:005557
NOD,B6.SCID Il2rγ−/−KitW41/W41 (NBSGW) The Jackson Laboratory RRID:IMSR_JAX:026622
Nunc delta 6-well plate THERMO SCIENTIFIC 140675
Polystyrene round-bottom tube BD 352008
P3 primary cell Nucleofection solution LONZA BIOSCIENCE PBP3-02250
Pasteur pipette FISHER SCIENTIFIC 13-678-20A
PCR clean-up kit TAKARA BIO 740609.25
Mouse Pie Cage FISCHER SCIENTIFIC 50-195-5140
polystyrene round-bottom tube (12 x 75 mm) STEMCELL TECHNOLOGIES 38007
Primer3 Whitehead Institute for Biomedical Research https://primer3.ut.ee/
QuickExtract™ DNA Extraction Solution Lucigen QE09050
Reserveratrol STEMCELL TECHNOLOGIES 72862
SCF PEPROTECH 300-07-1000
SFEM-II STEMCELL TECHNOLOGIES 9655
sgRNA SYNTHEGO
SPINWIN TARSON 1020
StemReginin 1 STEMCELL TECHNOLOGIES 72342
ICE analysis tool SYNTHEGO https://ice.synthego.com/
Tris-EDTA buffer solution (TE) 1X SYNTHEGO Supplied with gRNA 
Thermocycler APPLIED BIOSYSTEMS 4375305
TPO PEPROTECH 300-18-1000
Trypan blue HIMEDIA LABS TCL046
UM171 STEMCELL TECHNOLOGIES 72914
UM729 STEMCELL TECHNOLOGIES 72332
Xylazine XYLAXIN – INDIAN IMMUNOLOGICALS LIMITED

References

  1. Staal, F. J. T., Aiuti, A., Cavazzana, M. Autologous stem-cell-based gene therapy for inherited disorders: State of the art and perspectives. Frontiers in Pediatrics. 7, 443 (2019).
  2. Naldini, L. Genetic engineering of hematopoiesis: Current stage of clinical translation and future perspectives. EMBO Molecular Medicine. 11 (3), 9958 (2019).
  3. Srivastava, A., Shaji, R. V. Cure for thalassemia major – From allogeneic hematopoietic stem cell transplantation to gene therapy. Haematologica. 102 (2), 214-223 (2017).
  4. Venkatesan, V., Srinivasan, S., Babu, P., Thangavel, S. Manipulation of developmental gamma-globin gene expression: An approach for healing hemoglobinopathies. Molecular and Cellular Biology. 41 (1), 00253 (2020).
  5. Mazurier, F., Gan, O. I., McKenzie, J. L., Doedens, M., Dick, J. E. Lentivector-mediated clonal tracking reveals intrinsic heterogeneity in the human hematopoietic stem cell compartment and culture-induced stem cell impairment. Blood. 103 (2), 545-552 (2004).
  6. Piras, F., et al. Lentiviral vectors escape innate sensing but trigger p53 in human hematopoietic stem and progenitor cells. EMBO Molecular Medicine. 9 (9), 1198-1211 (2017).
  7. Christopher, A. C., et al. Preferential expansion of human CD34+CD133+CD90+ hematopoietic stem cells enhances gene-modified cell frequency for gene therapy. Human Gene Therapy. 33 (3-4), 188-201 (2021).
  8. Karuppusamy, K. V., et al. The CCR5 gene edited CD34+ CD90+ hematopoietic stem cell population serves as an optimal graft source for HIV gene therapy. Frontiers in Immunology. 13, 792684 (2022).
  9. Hopman, R. K., DiPersio, J. F. Advances in stem cell mobilization. Blood reviews. 28 (1), 31-40 (2014).
  10. Hoffman, T. L. Counting Cells. Cell Biology: A laboratory handbook. 1, 21-24 (2006).
  11. Antoniani, C., et al. Induction of fetal hemoglobin synthesis by CRISPR/Cas9-mediated editing of the human b-globin locus. Blood. 131 (17), 1960-1973 (2018).
  12. Azhagiri, M. K. K., Babu, P., Venkatesan, V., Thangavel, S. Homology-directed gene-editing approaches for hematopoietic stem and progenitor cell gene therapy. Stem Cell Research & Therapy. 12, 500 (2021).
  13. Desjardins, P., Conklin, D. NanoDrop microvolume quantitation of nucleic acids. Journal of Visualized Experiments. (45), e2565 (2010).
  14. Bagchi, A., et al. Direct generation of immortalized erythroid progenitor cell lines from peripheral blood mononuclear cells. Cells. 10 (3), 1-18 (2021).
  15. Ravi, R., et al. Identification of novel HPFH-like mutations by CRISPR base editing that elevates the expression of fetal hemoglobin. eLife. 11, 65421 (2020).
  16. Conant, D., et al. Inference of CRISPR edits from Sanger trace data. CRISPR Journal. 5 (1), 123-130 (2022).
  17. Shultz, L. D., et al. Human lymphoid and myeloid cell development in NOD/LtSz-scid IL2Rγnull mice engrafted with mobilized human hemopoietic stem cells. The Journal of Immunology. 174 (10), 6477-6489 (2005).
  18. McIntosh, B. E., et al. Nonirradiated NOD,B6.SCID Il2rγ-/- Kit(W41/W41) (NBSGW) mice support multilineage engraftment of human hematopoietic cells. Stem Cell Reports. 4 (2), 171-180 (2015).
  19. Leonard, A., et al. Low-dose busulfan reduces human CD34+ cell doses required for engraftment in c-kit mutant immunodeficient mice. Molecular Therapy – Methods & Clinical Development. 15, 430-437 (2019).
  20. Tateno, A., Sakai, K., Koya, N., Aoki, T. Effects of total asphyxia on the development of synaptic junctions in the brains of mice. Acta Paediatrica Japonica; Overseas Edition. 34 (1), 1-5 (1992).
  21. Audigé, A., et al. Long-term leukocyte reconstitution in NSG mice transplanted with human cord blood hematopoietic stem and progenitor cells. BMC Immunology. 18 (1), 1-15 (2017).
  22. Nimmerjahn, F., Ravetch, J. V. Fc-receptors as regulators of immunity. Advances in immunology. 96, 179-204 (2007).
  23. Boitano, A. E., et al. Aryl hydrocarbon receptor antagonists promote the expansion of human hematopoietic stem cells. Science. 329 (5997), 1345-1348 (2010).
  24. Ngom, M., et al. UM171 enhances lentiviral gene transfer and recovery of primitive human hematopoietic cells. Molecular Therapy – Methods & Clinical Development. 10, 156-164 (2018).
  25. Park, Y. S., et al. Enhancement of proliferation of human umbilical cord blood-derived CD34+ hematopoietic stem cells by a combination of hyper-interleukin-6 and small molecules. Biochemistry and Biophysics Reports. 29, 101214 (2022).
  26. Aiuti, A., et al. Lentivirus-based gene therapy of hematopoietic stem cells in Wiskott-Aldrich syndrome. Science. 341 (6148), 1233151 (2013).
  27. Rai, R., et al. Optimized cell culture conditions promote ex-vivo manipulation and expansion of primitive hematopoietic stem cells for therapeutic gene editing. bioRxiv. , (2022).
  28. Wilkinson, A. C., et al. Cas9-AAV6 gene correction of beta-globin in autologous HSCs improves sickle cell disease erythropoiesis in mice. Nature Communications. 12 (1), 1-9 (2021).
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Venkatesan, V., Christopher, A. C., Karuppusamy, K. V., Babu, P., Alagiri, M. K. K., Thangavel, S. CRISPR/Cas9 Gene Editing of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells for Gene Therapy Applications. J. Vis. Exp. (186), e64064, doi:10.3791/64064 (2022).

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