Journal

생물학

Un protocole pour l’utilisation de gènes série d’analyses d’enrichissement pour identifier le modèle Animal approprié de recherche translationnelle

JoVE 신문
생물학

JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다. 전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.

JoVE 신문 생물학

A Protocol for Using Gene Set Enrichment Analysis to Identify the Appropriate Animal Model for Translational Research

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Un protocole pour l’utilisation de gènes série d’analyses d’enrichissement pour identifier le modèle Animal approprié de recherche translationnelle

DOI:

10.3791/55768-v

•

09:35 min

•

August 16, 2017

•

Christopher Weidner, Matthias Steinfath, Elisa Wistorf, Michael Oelgeschläger, Marlon R. Schneider, Gilbert Schönfelder²

¹Department of Experimental Toxicology and ZEBET,German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), ²Department of Clinical Pharmacology and Toxicology,Charité-Universitätsmedizin Berlin

Chapters

00:05Title
00:54Performing the Game Set Enrichment Analysis (GSEA)
05:46Comparing the GSEA Results and Identifying the Optimal Animal Model
07:55Results: Overlap of Pathway Regulation Identifies Suitable and Unsuitable Animal Models
08:49Conclusion

Summary

자동 번역

Nous fournissons un protocole normalisé pour l’utilisation du gène enrichissement set analyse des données transcriptomiques pour identifier un modèle souris idéal pour la recherche translationnelle.
Ce protocole peut être utilisé avec les puces à ADN et des données de séquençage de l’ARN et encore peut être étendu à d’autres données omics si des données sont disponibles.

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Test sensibilité visuelle à la vitesse et la direction du mouvement chez les lézards

Computer-Generated Stimuli modèle animal

Utilisation du système d'électroporation Gene Pulser MXcell à transfecter des cellules primaires à haut rendement

Analyse du génome entier en utilisant ChIP d'identifier les gènes cibles spécifiques Isoform

La méthode de culture des embryons rongeurs entier en utilisant le système des rotateurs de type flacon de culture

Isolement du ribosome Bound polypeptides naissants<em> In vitro</em> Pour identifier les sites de pause de translation le long d'ARNm

Utilisation de la séquence d'arrêt SecM comme un outil pour isoler les polypeptides Ribosome Bound

Using Caenorhabditis elegans as a Model System to Study Protein Homeostasis in a Multicellular Organism

Xenopus laevis comme un modèle pour identifier traduction Dépréciation

Flux de travail complet pour l'analyse des histones modifications post-traductionnelles utilisant la spectrométrie de masse Bottom-up: De Histone Extraction à l'analyse des données

Un protocole pour l’utilisation de gènes série d’analyses d’enrichissement pour identifier le modèle Animal approprié de recherche translationnelle

•

•

•

Chapters

Summary

자동 번역

Tags

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

Test sensibilité visuelle à la vitesse et la direction du mouvement chez les lézards

Computer-Generated Stimuli modèle animal

Utilisation du système d'électroporation Gene Pulser MXcell à transfecter des cellules primaires à haut rendement

Analyse du génome entier en utilisant ChIP d'identifier les gènes cibles spécifiques Isoform

La méthode de culture des embryons rongeurs entier en utilisant le système des rotateurs de type flacon de culture

Isolement du ribosome Bound polypeptides naissants<em> In vitro</em> Pour identifier les sites de pause de translation le long d'ARNm

Utilisation de la séquence d'arrêt SecM comme un outil pour isoler les polypeptides Ribosome Bound

Using Caenorhabditis elegans as a Model System to Study Protein Homeostasis in a Multicellular Organism

Xenopus laevis comme un modèle pour identifier traduction Dépréciation

Flux de travail complet pour l'analyse des histones modifications post-traductionnelles utilisant la spectrométrie de masse Bottom-up: De Histone Extraction à l'analyse des données

Read Article