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인간 뇌 조직에서 단백질의 다중 반응 모니터링 기반 검출을 이용한 정량적 프로테오믹스 워크플로우
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JoVE 신문 생물학
Quantitative Proteomics Workflow using Multiple Reaction Monitoring Based Detection of Proteins from Human Brain Tissue
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인간 뇌 조직에서 단백질의 다중 반응 모니터링 기반 검출을 이용한 정량적 프로테오믹스 워크플로우

DOI:
10.3791/61833-v

•

11:49 min

•

August 28, 2021

•

, ,
1Centre for Research in Nanotechnology and Science,Indian Institute of Technology Bombay, 2Department of Biosciences and Bioengineering,Indian Institute of Technology Bombay

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:49Protein Extraction from Brain Tissue
  • 02:04Protein Quantification and Quality Check
  • 02:32Protein Digestion
  • 03:58Desalting and Peptide Quantification
  • 05:06Transition List Preparation of Finalised Targets
  • 07:30LC Parameters
  • 08:03MS Parameters
  • 08:25Run Sequence and Instrument QC
  • 09:08Method Refinement
  • 10:58Results and Conclusions

Summary

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이 프로토콜은 임상 샘플에서 단백질의 다중 반응 모니터링 (MRM)에 대한 트리플 쿼드러폴 질량 분광계의 사용을 소개하는 것을 목표로합니다. 우리는 샘플 준비에서 임상 샘플을 위한 데이터 분석에 이르기까지 필요한 모든 예방 조치를 취하도록 체계적인 워크플로우를 제공했습니다.

Tags

Quantitative ProteomicsMultiple Reaction MonitoringTargeted ProteomicsProtein DetectionSample PreparationProtein ExtractionProtein DigestionPeptide CleanupMass Spectrometry

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