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Fluxo de trabalho de proteômica quantitativa usando detecção baseada em monitoramento de múltiplas reações de proteínas do tecido cerebral humano
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JoVE 신문 생물학
Quantitative Proteomics Workflow using Multiple Reaction Monitoring Based Detection of Proteins from Human Brain Tissue

Fluxo de trabalho de proteômica quantitativa usando detecção baseada em monitoramento de múltiplas reações de proteínas do tecido cerebral humano

DOI:
10.3791/61833-v

•

11:49 min

•

August 28, 2021

•

, ,
1Centre for Research in Nanotechnology and Science,Indian Institute of Technology Bombay, 2Department of Biosciences and Bioengineering,Indian Institute of Technology Bombay

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:49Protein Extraction from Brain Tissue
  • 02:04Protein Quantification and Quality Check
  • 02:32Protein Digestion
  • 03:58Desalting and Peptide Quantification
  • 05:06Transition List Preparation of Finalised Targets
  • 07:30LC Parameters
  • 08:03MS Parameters
  • 08:25Run Sequence and Instrument QC
  • 09:08Method Refinement
  • 10:58Results and Conclusions

Summary

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O protocolo visa introduzir o uso de um espectrômetro de massa quadrupole triplo para monitoramento de reação múltipla (MRM) de proteínas de amostras clínicas. Fornecemos um fluxo de trabalho sistemático desde a preparação da amostra até a análise de dados para amostras clínicas com todas as precauções necessárias a serem tomadas.

Tags

Keywords: Quantitative ProteomicsMultiple Reaction MonitoringTargeted ProteomicsProtein DetectionSample PreparationProtein ExtractionProtein DigestionPeptide CleanupMass Spectrometry

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