Journal
/
Bioengineering
/
En ikke-sekvenserende tilnærming for rask deteksjon av RNA-redigering
JoVE Journal
Bioengineering
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Bioengineering
A Nonsequencing Approach for the Rapid Detection of RNA Editing

En ikke-sekvenserende tilnærming for rask deteksjon av RNA-redigering

DOI:
10.3791/63591-v

•

08:50 min

•

April 21, 2022

•

, ,
1Department of Bioscience and Biotechnology,Japan Advanced Institute of Science and Technology, 2BioSeeds Corporation,JAIST Venture Business Laboratory, Ishikawa Create Labo

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:17Optimization of the Target Fragment
  • 02:21Sample Preparations
  • 03:11Micro-Temperature Gradient Gel Electrophoresis (μTGGE) Analysis
  • 05:43Pattern Similarity Score (PaSS) Calculations
  • 06:35Results: Applying the μTGGE Method to Detect Single Nucleotide RNA Editing Events
  • 08:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Rask deteksjon og pålitelig kvantifisering av RNA-redigeringshendelser i genomisk skala er fortsatt utfordrende og er for tiden avhengig av direkte RNA-sekvenseringsmetoder. Protokollen beskrevet her bruker mikrotemperatur gradient gel elektroforese (μTGGE) som en enkel, rask og bærbar metode for å oppdage RNA-redigering.

Tags

RNA EditingNon-sequencing ApproachRapid DetectionPortable Temperature ElectrophoresisMicro-TGGEMelting ProfileSingle-base SubstitutionMolecular BiologyCDNA SynthesisPCR AmplificationPolyacrylamide Gel Electrophoresis

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/63591?article_type=v

Biomolecular Detection employing the Interferometric Reflectance Imaging Sensor (IRIS)
check_url/63591?article_type=v

Fabrication of Electrochemical-DNA Biosensors for the Reagentless Detection of Nucleic Acids, Proteins and Small Molecules
check_url/63591?article_type=v

En Cre-LOX P Rekombinasjon Approach for påvisning av Cell Fusion In Vivo</em
check_url/63591?article_type=v

Bakteriell Detection & Identification hjelp elektrokjemiske sensorer
check_url/63591?article_type=v

Time-lapse Fluorescence Imaging of Arabidopsis rotvekst med Rapid manipulering av Root miljøet ved hjelp av RootChip
check_url/63591?article_type=v

Skin tatovering som en ny tilnærming for DNA vaksine levering
check_url/63591?article_type=v

Karakterisering av Complex Systems Bruke Design of Experiments Approach: Forbigående Protein Expression i tobakk som et Case Study
check_url/63591?article_type=v

Nanomanipulation av Enkelt RNA-molekyler ved optisk pinsett
check_url/63591?article_type=v

Fluorescens Biomembrane Force Probe: Samtidig Kvantifisering av Receptor-ligand Kinetics og Binding-indusert intracellulære signal på en enkelt celle
check_url/63591?article_type=v

Rapid Mix Utarbeidelse av Bioinspired nanoskala hydroksyapatitt for Biomedical Applications

Read Article