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Uma abordagem não-sequencial para a detecção rápida da edição de RNA
JoVE Journal
Bioengineering
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JoVE Journal Bioengineering
A Nonsequencing Approach for the Rapid Detection of RNA Editing
DOI:

08:50 min

April 21, 2022

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:17Optimization of the Target Fragment
  • 02:21Sample Preparations
  • 03:11Micro-Temperature Gradient Gel Electrophoresis (μTGGE) Analysis
  • 05:43Pattern Similarity Score (PaSS) Calculations
  • 06:35Results: Applying the μTGGE Method to Detect Single Nucleotide RNA Editing Events
  • 08:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

A detecção rápida e a quantificação confiável dos eventos de edição de RNA em escala genômica permanecem desafiadoras e atualmente dependem de métodos de sequenciamento direto de RNA. O protocolo descrito aqui usa a eletroforese de gel de gradiente de microtemperatura (μTGGE) como um método simples, rápido e portátil de detectar a edição de RNA.

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