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Un approccio non sequenziale per il rilevamento rapido dell'editing dell'RNA
JoVE Journal
Bioengineering
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JoVE Journal Bioengineering
A Nonsequencing Approach for the Rapid Detection of RNA Editing
DOI:

08:50 min

April 21, 2022

, ,

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:17Optimization of the Target Fragment
  • 02:21Sample Preparations
  • 03:11Micro-Temperature Gradient Gel Electrophoresis (μTGGE) Analysis
  • 05:43Pattern Similarity Score (PaSS) Calculations
  • 06:35Results: Applying the μTGGE Method to Detect Single Nucleotide RNA Editing Events
  • 08:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

Il rilevamento rapido e la quantificazione affidabile degli eventi di modifica dell'RNA su scala genomica rimangono impegnativi e attualmente si basano su metodi di sequenziamento diretto dell'RNA. Il protocollo qui descritto utilizza l'elettroforesi su gel a gradiente di microtemperatura (μTGGE) come metodo semplice, rapido e portatile per rilevare l'editing dell'RNA.

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