A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:04Introduction
- 01:17Optimization of the Target Fragment
- 02:21Sample Preparations
- 03:11Micro-Temperature Gradient Gel Electrophoresis (μTGGE) Analysis
- 05:43Pattern Similarity Score (PaSS) Calculations
- 06:35Results: Applying the μTGGE Method to Detect Single Nucleotide RNA Editing Events
- 08:23Conclusion
Snabb detektion och tillförlitlig kvantifiering av RNA-redigeringshändelser i genomisk skala är fortfarande utmanande och förlitar sig för närvarande på direkta RNA-sekvenseringsmetoder. Protokollet som beskrivs här använder mikrotemperaturgradientgelelektrofores (μTGGE) som en enkel, snabb och bärbar metod för att detektera RNA-redigering.
