Yijun Ruan Genome Institute of Singapore Agency for Science, Technology and Research, Singapore Biography Publications Institution JoVE Articles Yijun Ruan has not added a biography. If you are Yijun Ruan and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications Valutazione Sistematica Dei Fattori Che Influenzano La Fedeltà Di ChIP-seq Nature Methods. Apr, 2012 | Pubmed ID: 22522655 Exome Sequenziamento Di Adenocarcinoma Gastrico Identifica Mutazioni Somatiche Ricorrenti Nell'adesione Delle Cellule E Geni Di Rimodellamento Della Cromatina Nature Genetics. Apr, 2012 | Pubmed ID: 22484628 Un Comune Polimorfismo Delezione BIM Media Resistenza Intrinseca E Risposte Inferiori a Inibitori Della Chinasi Della Tirosina in Cancro Nature Medicine. 2012 | Pubmed ID: 22426421 Interazioni Estese Della Cromatina Promotore-centrato Forniscono Una Base Topologica Per La Regolazione Della Trascrizione Cell. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22265404 Analisi Di Ampio Metraggio Trascrizione Del Genoma Usando 5' E 3' Accoppiato-fine-tag Next Generation Sequencing (RNA-PET) Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2012 | Pubmed ID: 22113299 Interactome CTCF-mediata Funzionale Della Cromatina in Cellule Pluripotenti Nature Genetics. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21685913 Indagini Ampia Diversità Virale DNA Ottenuto Attraverso Metagenomica Virale Delle Zanzare PloS One. 2011 | Pubmed ID: 21674005 Reti Di Interazione Della Cromatina E Architetture Di Ordine Superiore Di Genomi Eucariotici Journal of Cellular Biochemistry. Sep, 2011 | Pubmed ID: 21520242 Comprehensive Long-span Paired-end-tag Mapping Reveals Characteristic Patterns of Structural Variations in Epithelial Cancer Genomes Genome Research. May, 2011 | Pubmed ID: 21467267 Transcriptional Conseguenze Delle Aberrazioni Genomiche Strutturali Nel Cancro Al Seno Genome Research. May, 2011 | Pubmed ID: 21467264 Anniversario Del Sequenziamento Del Genoma. Presentando Il Genoma Umano: Ora in 3D! Science (New York, N.Y.). Feb, 2011 | Pubmed ID: 21350163 Determinazione Dell'associazione Di Fattore Di Trascrizione Nature Genetics. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21217639 Modello Integrativo Di Genomic Fattori Per Determinare La Selezione Del Sito Associazione Di Estrogeno Recettore-α Molecular Systems Biology. Dec, 2010 | Pubmed ID: 21179027 Analisi Genome-wide Rivelano Regolazione 2-dipendente Metilico-CpG-binding Protein Di MicroRNA in Un Modello Murino Di Sindrome Di Rett Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20921386 Sequenziamento Di Coppia-fine-ditag Parallelo Multiplex Approcci Nella Biologia Del Sistema Wiley Interdisciplinary Reviews. Systems Biology and Medicine. Mar-Apr, 2010 | Pubmed ID: 20836024 Rete Internazionale Di Progetti Di Genoma Del Cancro Nature. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20393554 Un'indagine Genomica Della Selezione Positiva Nella Burkholderia Pseudomallei Fornisce Intuizioni in Evoluzione Della Virulenza Accidentale PLoS Pathogens. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20368977 ChIA-PET Strumento Per L'analisi Di Interazione Completa Della Cromatina Con Sequenziamento Del Tag Di Fine Accoppiato Genome Biology. 2010 | Pubmed ID: 20181287 Analisi Di Interazione Della Cromatina Mediante Sequenziamento Del Tag Di Fine Accoppiato Current Protocols in Molecular Biology / Edited by Frederick M. Ausubel ... [et Al.]. Jan, 2010 | Pubmed ID: 20069536 Associazioni Preferenziali Tra Geni Co Rivelano Un Interactome Trascrizionale in Cellule Eritroidi Nature Genetics. Jan, 2010 | Pubmed ID: 20010836 Un Umano Cromatina Con Estrogeni-recettore Alfa-associazione Interactome Nature. Nov, 2009 | Pubmed ID: 19890323 Analisi Metagenomica Del Virus in Acqua Bonificata Environmental Microbiology. Nov, 2009 | Pubmed ID: 19555373 Recente Selezione Positiva Di Un Aplotipo Di Recettore Umano Androgeno Recettore/ectodysplasin A2 E La Sua Relazione a Calvizile Maschio Del Modello Human Genetics. Aug, 2009 | Pubmed ID: 19373488 Sequenziamento Del DNA Di Nuova Generazione Di Coppia-fine Tag (PET) Per Analisi Transcriptome E Genoma Genome Research. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19339662 De-novo Identificazione Dei Siti Di Legame Di PPARgamma/RXR E Bersagli Diretti Durante L'adipogenesi PloS One. 2009 | Pubmed ID: 19300518 Metodi Basati Su ChIP Per L'identificazione Delle Interazioni a Lungo Raggio Della Cromatina Journal of Cellular Biochemistry. May, 2009 | Pubmed ID: 19247990 Evoluzione Del Repertorio Dei Mammiferi Trascrizione Fattore Vincolante Tramite Elementi Trasponibili Genome Research. Nov, 2008 | Pubmed ID: 18682548 Affrontare L'Epigenoma in Cellule Staminali Pluripotenti Journal of Genetics and Genomics = Yi Chuan Xue Bao. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18640620 Integrazione Delle Vie Di Segnalazione Esterne Con Il Core Network Trascrizionale in Cellule Staminali Embrionali Cell. Jun, 2008 | Pubmed ID: 18555785 Metagenome Dispersa Nell'aria in Ambiente Urbano Indoor PloS One. 2008 | Pubmed ID: 18382653 Metagenomica Funzionale Profilatura Di Nove Biomi Nature. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18337718 Biodiversità E Biogeografia Dei Fagi Nel Moderne Stromatoliti E Thrombolites Nature. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18311127 L'uso Di Amplificazione Di Cilindrata Più Per Amplificare Complesse Librerie Di DNA Nucleic Acids Research. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18285362 Analisi Computazionale E Modellazione Di Distribuzione Avidità Del Genoma-scala Di Siti Di Legame Del Fattore Trascrizione in Esperimenti Di Chip-pet Genome Informatics. International Conference on Genome Informatics. 2007 | Pubmed ID: 18546507 Whole-genome Mapping Dell'istone H3 Lys4 E 27 Trimethylations Rivela Distinti Compartimenti Genomici in Cellule Staminali Embrionali Umane Cell Stem Cell. Sep, 2007 | Pubmed ID: 18371363 DiTagging Fine Accoppiato Per Analisi Transcriptome E Genoma Current Protocols in Molecular Biology / Edited by Frederick M. Ausubel ... [et Al.]. Jul, 2007 | Pubmed ID: 18265396 Genome-wide Mappatura Di RELA(p65) Associazione Identifica E2F1 Come Attivatore Trascrizionale Reclutato Da NF-kappaB All'attivazione TLR4 Molecular Cell. Aug, 2007 | Pubmed ID: 17707233 Aberrazioni Di Pathway Di Cellule Di Melanoma Murino Osservate in Abbinamento-fine DiTag Transcriptomes BMC Cancer. 2007 | Pubmed ID: 17594473 Identificazione E Analisi Degli Elementi Funzionali in 1% Del Genoma Umano Dal Progetto Pilota ENCODE Nature. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17571346 Mappatura Delle Regioni Di Legame Del Fattore Trascrizione in Cellule Di Mammifero Di ChIP: Confronto Delle Tecnologie Basate Su Array E Sequenziamento Genome Research. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17568005 Pseudogeni Nelle Regioni ENCODE: Annotazione Di Consenso, Analisi Della Trascrizione E L'evoluzione Genome Research. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17568002 Trascrizioni Di Fusione E Trascritto Retrotransposed Loci Scoperti Attraverso Analisi Esauriente Del Transcriptome Utilizzando Associati-fine DiTags (animali Domestici) Genome Research. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17568001 Genoma Di Tutta La Cartografia Dei Siti Di Legame Con Estrogeno Recettore Alfa PLoS Genetics. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17542648 Un Approccio Di Genomica Per Comprendere La Risposta Ospite Durante L'infezione Di Dengue Novartis Foundation Symposium. 2006 | Pubmed ID: 17319164 Mappatura Globale Dei Siti Di Legame Di C-Myc E Reti Gene Bersaglio Nelle Cellule Umane B Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Nov, 2006 | Pubmed ID: 17093053 PET-Tool: Una Suite Di Software Per La Completa Elaborazione E Gestione Dei Dati Di Sequenza Di Abbinamento-fine DiTag (PET) BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 16934139 Multiplex Sequenziamento Di Coppia-fine Ditags (MS-PET): Una Strategia Per L'analisi Di Ultra-high-throughput Di Transcriptomes E Genomi Nucleic Acids Research. 2006 | Pubmed ID: 16840528 La Rete Di Trascrizione Oct4 E Nanog Regola La Pluripotenza in Cellule Staminali Embrionali Di Topo Nature Genetics. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16518401 Mappa Globale Di Siti Di Legame Del Fattore Di Trascrizione P53 Nel Genoma Umano Cell. Jan, 2006 | Pubmed ID: 16413492 Comunità Virali RNA Nelle Feci Umane: La Prevalenza Del Virus Patogeni Vegetali PLoS Biology. Jan, 2006 | Pubmed ID: 16336043 Transcriptome Analisi Di Zebrafish Embriogenesi Usando I Microarrays PLoS Genetics. Aug, 2005 | Pubmed ID: 16132083 Gene Identificazione Firma (GIS) Analisi Per Annotazione Del Genoma E Caratterizzazione Transcriptome Nature Methods. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15782207 Schema Di Trasmissione Di SARS a Singapore Rivalutato Da Analisi Di Variazione Di Sequenza Virale PLoS Medicine. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15736999 La Status, La Qualità E L'espansione Del Progetto Full-length CDNA NIH: L'insieme Dei Mammiferi Di Gene (MGC) Genome Research. Oct, 2004 | Pubmed ID: 15489334 Mutational Dinamiche Del Coronavirus SARS in Coltura Cellulare E Popolazioni Umane Isolate Nel 2003 BMC Infectious Diseases. Sep, 2004 | Pubmed ID: 15347429 5' Lunga Serie Analisi Di Espressione Genica (LongSAGE) E 3' LongSAGE Per L'annotazione Del Genoma E Caratterizzazione Transcriptome Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2004 | Pubmed ID: 15272081 Laboratorio-acquisita Sindrome Respiratoria Acuta Grave The New England Journal of Medicine. Apr, 2004 | Pubmed ID: 15103000 Interrogare Il Trascrittoma Trends in Biotechnology. Jan, 2004 | Pubmed ID: 14690619 Cromatina Analisi Interazioni con Tag Sequencing appaiati-End (Chia-PET) per la mappatura Interazioni cromatina e comprensione del regolamento Trascrizione Yufen Goh*1, Melissa J. Fullwood*1,2,3, Huay Mei Poh1, Su Qin Peh1, Chin Thing Ong1, Jingyao Zhang1, Xiaoan Ruan1, Yijun Ruan1,3 1Genome Institute of Singapore, Agency for Science, Technology and Research, Singapore, 2A*STAR-Duke-NUS Neuroscience Research Partnership, Singapore, 3Department of Biochemistry, National University of Singapore, Singapore JoVE 3770 Biologia
Cromatina Analisi Interazioni con Tag Sequencing appaiati-End (Chia-PET) per la mappatura Interazioni cromatina e comprensione del regolamento Trascrizione Yufen Goh*1, Melissa J. Fullwood*1,2,3, Huay Mei Poh1, Su Qin Peh1, Chin Thing Ong1, Jingyao Zhang1, Xiaoan Ruan1, Yijun Ruan1,3 1Genome Institute of Singapore, Agency for Science, Technology and Research, Singapore, 2A*STAR-Duke-NUS Neuroscience Research Partnership, Singapore, 3Department of Biochemistry, National University of Singapore, Singapore JoVE 3770 Biologia