Summary

Visualizzazione di formazione di aderenze in cellule per mezzo di avanzati filatura microscopia di fluorescenza di riflessione interna totale disco

Published: January 21, 2019
doi:

Summary

Imaging di entrambi, l’isolato della membrana plasmatica e il volume intracellulare circostante, sarà presentato un microscopio avanzato che consentono veloce e ad alta risoluzione. L’integrazione di filatura disco e totale microscopia di fluorescenza di riflessione interna in un’unica configurazione permette esperimenti dal vivo imaging al prezzo di acquisizione alta fino a 3,5 s per serie di immagini.

Abstract

In cellule viventi, processi quali la formazione di aderenze coinvolgono vasti cambiamenti strutturali nella membrana plasmatica e l’interno delle cellule. Per visualizzare questi eventi altamente dinamici, sono stati combinati due tecniche di microscopia chiara complementari che permettono la formazione immagine veloce dei campioni dal vivo: filatura microscopia disco (SD) per la registrazione veloce e ad alta risoluzione volume e riflessione interna totale microscopia a fluorescenza (TIRF) per localizzazione precisa e la visualizzazione della membrana plasmatica. Verrà mostrato un protocollo di formazione immagine ampio e completo per guidare attraverso la preparazione del campione, taratura del microscopio, formazione dell’immagine e acquisizione, con conseguente serie di formazione immagine multicolore SD-TIRF dal vivo ad alta risoluzione spazio-temporale. Tutti i passaggi di post-elaborazione immagine necessaria per generare dataset multidimensionale in imaging dal vivo, cioè registrazione e combinazione dei singoli canali, sono forniti in una macro auto-scritta per il software open source ImageJ. L’imaging di proteine fluorescenti durante l’inizio e la maturazione dei complessi di adesione, così come la formazione della rete del citoscheletro di actina, è stato utilizzato come una prova di principio per questo nuovo approccio. La combinazione di microscopia 3D ad alta risoluzione e TIRF ha fornito una descrizione dettagliata di questi processi complessi all’interno dell’ambiente cellulare e, allo stesso tempo, precisa localizzazione delle molecole di membrana-collegato rilevato con un alto rapporto di segnale–fondo.

Introduction

Nostri giorni, tecniche di microscopia chiara fornendo alta/super risoluzione imaging in fissa ed esemplare vivente sono in rapida evoluzione. Tecniche di Super-risoluzione stimolato microscopia di emissione svuotamento (STED), strutturato illuminazione (SIM) e microscopia di localizzazione foto-attivazione (PALM) o microscopia diretta ricostruzione ottica stocastica (tempesta), rispettivamente, sono disponibili in commercio e permettono la formazione immagine di strutture subcellulari mostrano dettagli quasi su scala molecolare1,2,3,4,5,6. Tuttavia, questi approcci ancora limitata applicabilità per esperimenti di imaging dal vivo in cui grandi volumi devono essere visualizzate con più fotogrammi al secondo velocità di acquisizione. Varietà dei processi altamente dinamici regolamentati tramite la membrana del plasma, ad es. endo- / esocitosi, adesione, migrazione o segnalazione, si verificano con l’alta velocità all’interno di grandi volumi di cellulare. Recentemente, al fine di riempire questa lacuna, una tecnica di microscopia integrato era proposto chiamato filatura disco-TIRF (SD-TIRF)7. In dettaglio, la microscopia TIRF consente specificamente isolare e localizzare la membrana plasmatica8,9, mentre la microscopia SD è uno della più sensibile e veloce live tecniche di imaging per la visualizzazione e il monitoraggio di organelli sottocellulari nel citoplasma10,11. La combinazione di due tecniche di imaging in un unico setup è stata realizzata già nel passato12,13, tuttavia, il microscopio presentato qui (Figura 1) infine soddisfa i criteri per eseguire esperimenti di SD-TIRF imaging dal vivo dei suddetti processi a 3 fotogrammi al secondo di velocità. Poiché questo microscopio è commercialmente disponibile, l’obiettivo di questo manoscritto è quello di descrivere in dettaglio e fornire strumenti open source e protocolli per l’acquisizione delle immagini, registrazione e visualizzazione associata con microscopia di SD-TIRF.

Il programma di installazione si basa su un microscopio invertito a scansione due unità tramite porte indipendenti – la porta di sinistra è collegata all’unità SD e porta posteriore per unità scanner per TIRF e foto-attivazione /-candeggio esperimenti. Fino a 6 laser (405/445/488/515/561/640 nm) può essere utilizzato per l’eccitazione. Per il rilevamento del segnale di fluorescenza, sia una 100 x ed eccitazione / NA1.45 olio o x 60 / NA1.49 olio obiettivo TIRF, rispettivamente, sono stati impiegati. La luce emessa è divisa da uno specchio dicroico (561 nm long-pass o 514 nm long-pass) e filtrata dai vari filtri passa-banda (55 nm vasta centrata a 525 nm, 54 nm vasta centrata a 609 nm per fluorescenza verde e rosso, rispettivamente) posizionato davanti alla cam EM-CCD due ere. Siete pregati di notare che ulteriori dettagli tecnici sull’installazione sono elencati in Zobiak et al. 7. in configurazione TIRF, l’unità SD viene spostato fuori dal percorso della luce all’interno di circa 0,5 s affinché le stesse due telecamere possono essere utilizzate per il rilevamento, consentendo più veloce di commutazione tra le due modalità di imaging, rispetto ai circa 1 s è stato segnalato in passato13 . Questa funzionalità consente acquisizione simultanea dual channel, quindi 4 canali SD-TIRF imaging in precedenza Velocità ineguagliata e precisione possa essere eseguite. Inoltre, l’allineamento tra le immagini SD e TIRF è inutile. Allineamento dell’immagine tra le due fotocamere, tuttavia, deve essere controllato prima di iniziare l’esperimento ed eventualmente corretto. Nel seguente protocollo, una routine di correzione di registrazione è stata implementata in una macro di ImageJ auto-scritta. Inoltre, la macro è stata progettata principalmente per consentire una visualizzazione simultanea dei DataSet TIRF nonostante la loro diversa dimensionalità e SD. Il software di acquisizione in sé non ha fornito queste caratteristiche.

Protocol

1. preparazione delle celle Due giorni prima dell’esperimento, seme 3 * 105 HeLa o NIH3T3 cellule in 2 mL di terreno di sviluppo completo per pozzetto di una piastra di coltura cellulare 6 pozzetti. Assicurarsi che le celle vengano gestite in una cappa a flusso laminare in tutto questo protocollo. Un giorno prima dell’esperimento, preparare i reagenti di transfezione secondo le raccomandazioni del produttore o un protocollo empiricamente determinato, ad esempio: Diluire 1 ?…

Representative Results

Al fine di mostrare il potenziale di formazione immagine SD-TIRF, che un’analisi è stata sviluppata che dovrebbe rivelare l’organizzazione spazio-temporale dei complessi di adesione cellula-matrice e loro interazione con il citoscheletro durante l’adesione cellulare. Di conseguenza, aderente HeLa o, in alternativa, NIH3T3 cellule transfected con YFP-vinculina e RFP-Lifeact per 18-24 h, tripsinizzate e seminate su piatti di fondo di vetro rivestite di fibronectina. Queste linee cellulari …

Discussion

In questa carta è stata presentata la prima implementazione di successo di SD e TIRF microscopia in una configurazione adatta per l’esecuzione di esperimenti imaging di cellule vive, cioè i tassi di acquisizione alta quali 2 serie di SD-TIRF immagini al minuto a 3 diversi stadi posizioni, corrispondenti a un totale di 168 fotogrammi (circa 3 fotogrammi al secondo), sono state acquisite. I microscopi di SD-TIRF pochi che erano precedentemente descritto12,13</…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Ringraziamo enormemente la comunità scientifica della University Medical Center Hamburg-Eppendorf per averci sostenuto con campioni per la valutazione. Vale a dire, noi ringraziamo Sabine Windhorst per cellule NIH3T3, Andrea Mordhorst per YFP-vinculina e Maren Rudolph per RFP-Lifeact.

Materials

Microscope and accessories
SD-TIRF microscope Visitron Systems
Ti with perfect focus system Nikon Inverted microscope stand
CSU-W1 T2 Yokogawa Spinning disk unit in dual-camera configuration
iLAS2  Roper Scientific TIRF/FRAP scanner
Evolve  Photometrix EM-CCD cameras
PiezoZ stage Ludl Electronic Products Motorized Z stage
Bioprecision2 XY stage Ludl Electronic Products Motorized XY stage
Stage top incubation chamber Okolab Bold Line Temperature, CO2 and humidity supply
Cell culture
HeLa cervical cancer cells DSMZ ACC-57
NIH3T3 fibroblasts DSMZ ACC-59
Dulbecco's phosphate buffered saline (PBS) Gibco 14190144
Trypsin-EDTA 0.05% Gibco 25300054
Dulbecco's Modified Eagle Medium + GlutaMAX-I (DMEM) Gibco 31966-021
OptiMEM Gibco 31985070 Reduced serum medium
Fetal calf serum (FCS) Gibco 10500064
Penicillin/Streptomycin (PenStrep) Gibco 15140148
Full growth medium (DMEM supplemented with 10% FCS and 1% PenStrep)
TurboFect ThermoFisher Scientific R0531 Transfection reagent
Ascorbic acid (AA) Sigma A544-25G
6-well cell culture plate Sarstedt 83.392
Glass bottom dishes MatTek P35G-1.5-10-C 35mm, 0.17mm glass coverslip
Fibronectin, bovine plasma ThermoFisher Scientific 33010018
Neubauer improved chamber VWR 631-0696
TetraSpeck beads ThermoFisher Scientific T7279
Plasmids
RFP-Lifeact Maren Rudolph, Institute of Medical Microbiology, University Medical Center Hamburg Eppendorf, Germany
YFP-Vinculin Andrea Mordhorst, Institute of Medical Microbiology, University Medical Center Hamburg Eppendorf, Germany
Software and plugins
VisiView Visitron Systems Version 3
ImageJ Version 1.52c
Turboreg plugin http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/turboreg/
Macro "SD-TIRF_helper_JoVE.ijm" this publication https://github.com/bzobiak/ImageJ
Volocity PerkinElmer Version 6.2.2

Referências

  1. Hell, S. W., Wichmann, J. Breaking the diffraction resolution limit by stimulated emission: stimulated-emission-depletion fluorescence microscopy. Optics Letters. 19 (11), 780 (1994).
  2. Gustafsson, M. G. L. Surpassing the lateral resolution limit by a factor of two using structured illumination microscopy. Journal of Microscopy. 198 (2), 82-87 (2000).
  3. Betzig, E., et al. Imaging intracellular fluorescent proteins at nanometer resolution. Science. 313 (5793), 1642-1645 (2006).
  4. Hess, S. T., Girirajan, T. P. K., Mason, M. D. Ultra-high resolution imaging by fluorescence photoactivation localization microscopy. Biophysical Journal. 91 (11), 4258-4272 (2006).
  5. Rust, M. J., Bates, M., Zhuang, X. Sub-diffraction-limit imaging by stochastic optical reconstruction microscopy (STORM). Nature methods. 3 (10), 793-796 (2006).
  6. van de Linde, S., et al. Direct stochastic optical reconstruction microscopy with standard fluorescent probes. Nature protocols. 6 (7), 991-1009 (2011).
  7. Zobiak, B., Failla, A. V. Advanced spinning disk-TIRF microscopy for faster imaging of the cell interior and the plasma membrane. Journal of Microscopy. 269 (3), 282-290 (2018).
  8. Mattheyses, A. L., Simon, S. M., Rappoport, J. Z. Imaging with total internal reflection fluorescence microscopy for the cell biologist. Journal of Cell Science. 123 (21), 3621-3628 (2010).
  9. Burchfield, J. G., Lopez, J. A., Vallotton, P., William, E. Exocytotic vesicle behaviour assessed by total internal reflection fluorescence microscopy. Traffic. 11 (4), 429-439 (2010).
  10. Oreopoulos, J., Berman, R., Browne, M. Spinning-disk confocal microscopy. present technology and future trends. Methods in Cell Biology. 123, 153-175 (2014).
  11. Murray, J. M., Appleton, P. L., Swedlow, J. R., Waters, J. C. Evaluating performance in three-dimensional fluorescence microscopy. Journal of Microscopy. 228 (3), 390-405 (2007).
  12. Trache, A., Lim, S. -. M. Integrated microscopy for real-time imaging of mechanotransduction studies in live cells. Journal of Biomedical Optics. 14 (3), 034024 (2009).
  13. Stehbens, S., Pemble, H., Murrow, L., Wittmann, T. Imaging intracellular protein dynamics by spinning disk confocal microscopy. Methods in Enzymology. , 293-313 (2012).
  14. Waldchen, S., Lehmann, J., Klein, T., Van De Linde, S., Sauer, M. Light-induced cell damage in live-cell super-resolution microscopy. Scientific Reports. 5, 1-12 (2015).
  15. Schindelin, J., et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nature Methods. 9 (7), 676-682 (2012).
  16. Thévenaz, P., Ruttimann, U. E., Unser, M. A pyramid approach to subpixel registration based on intensity. IEEE Transactions on Image Processing. 7 (1), 27-41 (1998).
  17. Partridge, M. A. Initiation of attachment and generation of mature focal adhesions by integrin-containing filopodia in cell spreading. Molecular Biology of the Cell. 17 (10), (2006).
  18. Dubin-Thaler, B. J., Giannone, G., Döbereiner, H. G., Sheetz, M. P. Nanometer analysis of cell spreading on matrix-coated surfaces reveals two distinct cell states and STEPs. Biophysical Journal. 86 (3), 1794-1806 (2004).
  19. Choi, C. K., Vicente-Manzanares, M., Zareno, J., Whitmore, L. A., Mogilner, A., Horwitz, A. R. Actin and α-actinin orchestrate the assembly and maturation of nascent adhesions in a myosin II motor-independent manner. Nature Cell Biology. 10 (9), 1039-1050 (2008).
  20. Bachir, A. I., Zareno, J., Moissoglu, K., Plow, E. F., Gratton, E., Horwitz, A. R. Integrin-associated complexes form hierarchically with variable stoichiometry in nascent adhesions. Current Biology. 24 (16), 1845-1853 (2014).
  21. Sun, Z., Guo, S. S., Fässler, R. Integrin-mediated mechanotransduction. Journal of Cell Biology. 215 (4), 445-456 (2016).
  22. Shao, L., Kner, P., Rego, E. H., Gustafsson, M. G. L. Super-resolution 3D microscopy of live whole cells using structured illumination. Nat. Methods. 8 (12), 1044-1046 (2011).
  23. Chen, B. -. C., et al. Lattice light-sheet microscopy: Imaging molecules to embryos at high spatiotemporal resolution. Science. 346 (6208), 1257998-1257998 (2014).
  24. Fu, Y., Winter, P. W., Rojas, R., Wang, V., McAuliffe, M., Patterson, G. H. Axial superresolution via multiangle TIRF microscopy with sequential imaging and photobleaching. Proceedings of the National Academy of Sciences. 113 (16), 4368-4373 (2016).
  25. Boulanger, J., et al. Fast high-resolution 3D total internal reflection fluorescence microscopy by incidence angle scanning and azimuthal averaging. Proceedings of the National Academy of Sciences. 111 (48), 17164-17169 (2014).
check_url/pt/58756?article_type=t

Play Video

Citar este artigo
Zobiak, B., Failla, A. V. Visualizing Adhesion Formation in Cells by Means of Advanced Spinning Disk-Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy. J. Vis. Exp. (143), e58756, doi:10.3791/58756 (2019).

View Video