Journal
/
/
Сегментация криоэлектронных томограмм на основе глубокого обучения
JoVE Journal
Biologia
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
Deep Learning-Based Segmentation of Cryo-Electron Tomograms
DOI:

10:25 min

November 11, 2022

, , , , ,

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:45Image Import and Preprocessing
  • 02:45Creating Training Data
  • 05:13Using the Segmentation Wizard for Iterative Training
  • 06:52Apply the Network
  • 07:36Segmentation Manipulation and Cleanup
  • 08:16Results: Analysis of the Tomogram of DIV 5 Hippocampal Rat Neuron
  • 09:40Conclusion

Summary

Tadução automática

Это метод обучения многосрезовой U-Net для многоклассовой сегментации криоэлектронных томограмм с использованием части одной томограммы в качестве обучающего входа. Мы описываем, как вывести эту сеть из других томограмм и как извлечь сегментации для дальнейшего анализа, такого как усреднение субтомограмм и трассировка нитей.

Vídeos Relacionados

Read Article