Journal
/
/
Kriyo-Elektron Tomogramlarının Derin Öğrenme Tabanlı Segmentasyonu
JoVE Journal
Biologia
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
Deep Learning-Based Segmentation of Cryo-Electron Tomograms
DOI:

10:25 min

November 11, 2022

, , , , ,

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:45Image Import and Preprocessing
  • 02:45Creating Training Data
  • 05:13Using the Segmentation Wizard for Iterative Training
  • 06:52Apply the Network
  • 07:36Segmentation Manipulation and Cleanup
  • 08:16Results: Analysis of the Tomogram of DIV 5 Hippocampal Rat Neuron
  • 09:40Conclusion

Summary

Tadução automática

Bu, bir tomogramın bir kısmını eğitim girdisi olarak kullanarak kriyo-elektron tomogramlarının çok sınıflı segmentasyonu için çok dilimli bir U-Net'i eğitmek için kullanılan bir yöntemdir. Bu ağın diğer tomogramlara nasıl çıkarılacağını ve subtomogram ortalaması ve filament izleme gibi daha ileri analizler için segmentasyonların nasıl çıkarılacağını açıklıyoruz.

Vídeos Relacionados

Read Article