Journal
/
/
Djupinlärningsbaserad segmentering av kryoelektrontomogram
JoVE Journal
Biologia
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
Deep Learning-Based Segmentation of Cryo-Electron Tomograms
DOI:

10:25 min

November 11, 2022

, , , , ,

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:45Image Import and Preprocessing
  • 02:45Creating Training Data
  • 05:13Using the Segmentation Wizard for Iterative Training
  • 06:52Apply the Network
  • 07:36Segmentation Manipulation and Cleanup
  • 08:16Results: Analysis of the Tomogram of DIV 5 Hippocampal Rat Neuron
  • 09:40Conclusion

Summary

Tadução automática

Detta är en metod för att träna ett U-Net med flera skivor för segmentering av kryoelektrontomogram med flera klasser med hjälp av en del av ett tomogram som träningsingång. Vi beskriver hur man härleder detta nätverk till andra tomogram och hur man extraherar segmenteringar för vidare analyser, såsom subtomogrammedelvärde och filamentspårning.

Vídeos Relacionados

Read Article