Ødeleggelsen av korn avlinger ved frø-smitte sopp har bedt en rekke forskningsinnsats for å bedre forstå plante-patogen interaksjoner. Å studere frø-sopp interaksjoner i et laboratorium setting, utviklet vi en robust metode for kvantifisering av sopp reproduksjon, biomasse, og mykotoksin forurensning ved hjelp av kernel bioassay.
Den råtnende av korn ved frø-smitte sopp utgjør en av de største økonomiske utfordringene til kornproduksjon i verden, for ikke å nevne alvorlige risikoer for menneskers og dyrs helse. Blant kornproduksjon, er mais uten tvil den mest berørte avling, grunnet patogen-induserte tap i korn integritet og mykotoksin frø forurensning. De to mest utbredte og problematisk mykotoksiner for mais growers og mat og fôr prosessorer er aflatoksin og fumonisin, produsert av Aspergillus flavus og Fusarium verticillioides, henholdsvis.
Nyere studier i molekylære plante-patogen interaksjoner har vist lovende i å forstå spesifikke mekanismer knyttet til plante svar soppinfeksjon og mykotoksin forurensning 1,2,3,4,5,6. Fordi mange laboratorier bruker kernel-analyser for å studere plante-patogen interaksjoner, er det behov for en standardisert metode for å kvantifisere ulike biologiske parametre, såresultater fra ulike laboratorier kan kryss-tolket. For en robust og reproduserbar måte for kvantitative analyser på frø, har vi utviklet i-lab kernel analyser og påfølgende metoder for å kvantifisere soppvekst, biomasse, og mykotoksin forurensning. Fire steriliserte mais kjerner er inokulert i hetteglass med en sopp suspensjon (10 6) og inkubert for en forhåndsbestemt periode. Smak ampuller blir deretter valgt for telling av conidia av hemocytometer, ergosterol-basert biomasse analyse av høy ytelse væskekromatografi (HPLC), aflatoksin kvantifisering ved hjelp av en AflaTest fluorometer metode, og fumonisin kvantifisering av HPLC.
The authors have nothing to disclose.
Vi ønsker å takke Brandon Hassett og Carlos Ortiz for deres tekniske assistanse. Dette arbeidet ble støttet av NSF tilskudd IOB-0544428, IOS-0951272, og IOS-0925561 Dr. Michael Kolomiets, og av USDA National Institute of Food and Agriculture (NIFA), Afri planteforedling og utdanning Grant # 2010-85117 -20539 til legene. Seth Murray, Thomas Isakeit, og Michael Kolomiets.
Name of the reagent | Company | Catalog # |
Potato Dextrose Agar | Fisher Scientifc | S71659A |
Tween-20 | Fisher Scientifc | BP337-100 |
Plastic incubation container | Sterilite | 1713LAB06 |
Blender | Vicam | 20200 |
24 cm Fluted Filter Papers | Vicam | 31240 |
1.5 μm glass microfibre | Vicam | 31955 |
Afla Test column | Vicam | G1024 |
Afrla Test Developer | Vicam | 32010 |
Methanol | Vicam | 35016 |
Acetonitrile | Fisher Scientifc | AC14952-0025 |
Ethanol | Fisher Scientifc | AC39769-0025 |
C-18 solid phase extraction column (Prep SEP SPE C18 Column) | Fisher Scientifc | 60108-304 |
O-phthalaldehyde (OPA) | Sigma Chemical Co | 79760-5g |
Boric acid | Fisher Scientifc | BP168-500 |
Sodium borate | Fisher Scientifc | RDCS0330500 |
Mercaptoethanol | Fisher Scientifc | 45-000-231 |
Shimadzu HPLC LC-20AT (Pump) | Shimadzu Scientific Instruments, Inc. | LC-20AT |
Zorbax ODS column (4.6x150mm) | Agilent Technologies | 443905-902 |
Shimatzu RF-10Axl fluorescence detector | Shimadzu Scientific Instruments, Inc. | RF-10AXL |
Sodium phosphate | Fisher Scientifc | AC38987-0010 |
FB1 standards | Sigma Chemical Co. | F1147-1mg |
Chloroform | VWR | MK444410 |
13 mm syringe filter with 0.45 um nylon membrane (HPLC) | Pall Life Science | 4426 |
Ergosterol | Sigma-Aldrich | 45480-50G-F |
Scintillation vials | VWR | 66021-602 |
Sodium Chloride | Vicam | G1124 |