In vitro analyse van PDZ-afhankelijke CFTR Macromoleculaire signaalcomplexen
Summary
Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR), een epitheliale chloride kanaal, is gemeld om te communiceren met verschillende eiwitten en belangrijke cellulaire processen te reguleren, onder wie de CFTR PDZ motief-gemedieerde interacties zijn goed gedocumenteerd. Dit protocol beschrijft methodes die we ontwikkeld tot een PDZ-afhankelijke CFTR macromoleculaire signaleren van complexe monteren<em> In vitro</em>.
Abstract
Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR), een chloride kanaal voornamelijk gevestigd zijn op de apicale membranen van epitheliale cellen, speelt een cruciale rol in transepitheliaal vloeistof homeostase 1-3. CFTR is betrokken bij twee belangrijke ziekten: cystische fibrose (CF) 4 en secretoire diarree 5. In CF, is de synthese of functionele activiteit van het CFTR Cl-kanaal verminderd. Deze aandoening treft ongeveer 1 op de 2.500 blanken in de Verenigde Staten 6. Overmatige CFTR-activiteit is ook betrokken in geval van toxine-geïnduceerde secretoire diarree (bijvoorbeeld door cholera toxine en warmte stabiele E. coli enterotoxine), die cAMP of cGMP productie in de darm 7 stimuleert.
Opstapelen van bewijsmateriaal dat suggereert het bestaan van fysieke en functionele interacties tussen CFTR en een groeiend aantal andere eiwitten, waaronder vervoerders, ionkanalen, receptoren, kinasen, fosfatasen, signaaling moleculen en cytoskelet elementen en deze interacties tussen CFTR en bindende eiwitten aangetoond kritisch bij de regulering CFTR-gemedieerde transepitheliaal ionentransport in vitro en in vivo 8-19. In dit protocol richten we ons alleen op de methoden die helpen bij de studie van de interacties tussen CFTR carboxyl-terminale staart, die een eiwit-bindend motief bezit [aangeduid als PSD95/Dlg1/ZO-1 (PDZ) motief], en een groep van raamwerk eiwitten die een specifieke binding module bevatten genoemd PDZ domeinen. Tot nu toe zijn verschillende PDZ raamwerk eiwitten is gerapporteerd dat de carboxyl terminal staart van CFTR binden met verschillende affiniteiten zoals Nherf1, Nherf2, PDZK1, PDZK2, CAL (CFTR-geassocieerde ligand), Shank2 en 20-27 bevatten. De PDZ motief in CFTR dat wordt herkend door PDZ steiger eiwitten is de laatste vier aminozuren aan de C-terminus (dat wil zeggen, 1477-Dtrl-1480 in de menselijke CFTR) 20. InteressantCFTR kunnen binden meer dan een PDZ-domein van zowel NHERFs en PDZK1, zij het met verschillende affiniteiten 22. Dit multivalency met betrekking tot CFTR binding is gebleken functionele betekenis suggereert dat PDZ raamwerk eiwitten kunnen vorming van CFTR macromoleculaire vergemakkelijken signaalcomplexen specifieke / selectieve en efficiënte signalering in cellen 16-18.
Meerdere biochemische testen zijn ontwikkeld om te studeren CFTR-met eiwit interacties, zoals co-immunoprecipitatie, pull-down test, paarsgewijs bindingstest, colorimetrische paarsgewijs bindingstest, en macromoleculaire complexe assemblage-test 16-19,28,29 . Hier richten we ons op de gedetailleerde procedures voor het samenstellen van een PDZ motief-afhankelijke CFTR-bevattende macromoleculaire complex in vitro, die op grote schaal wordt gebruikt door ons laboratorium om eiwit-eiwit of domein-domain interacties van CFTR 16-19,28,29 te bestuderen.
Protocol
Discussion
In dit protocol we aangetoond dat een werkwijze voor in vitro montage en detectie van een CFTR met macromoleculaire signaleringscomplex met gezuiverde eiwitten (of eiwitfragmenten) en / of cellysaten Zoals eerder 16-19,29,30. Om dit te bereiken de beste resultaten de volgende kritische punten tijdens de voorbereiding vereisen speciale aandacht:
- Het is belangrijk dat de pH van de elutiebuffer aangepast tot 8,0 na toevoegen gereduceerd glutathion als zuivering van GST-fusieproteïne zoals …
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
Ons werk werd ondersteund door subsidies van de American Heart Association (Groot-Zuidoost Affiliate) Begin-subsidie-in-aid 0765185B, de Elsa U. Pardee Foundation onderzoek te verlenen, en Wayne State University intramurale het opstarten van het fonds en de Cardiovascular Research Institute Isis Initiative award. Deze methode van in-vitro-CFTR macromoleculaire complexe assemblage werd oorspronkelijk ontwikkeld door dr. AP Naren (University of Tennessee Health Science Center).
Materials
| Name of the reagent | Company | Catalog number | Comments |
| pGEX4T-1 vector | GE Healthcare | 28-9545-49 | formerly Amersham Biosciences |
| pMAL-C2 vector | New England BioLabs | ||
| pET30 vector | EMD Chemicals | 69077-3 | formerly Novagen |
| Glutathione agarose beads | BD Biosciences | 554780 | |
| Amylose resin | New England BioLabs | E8021S | |
| Talon beads | Clontech | 635501 | |
| reduced glutathione | BD Biosciences | 554782 | |
| imidazole | Fisher | BP305-50 | |
| maltose | Fisher | BP684-500 | |
| S-protein agarose | EMD Chemicals | 69704-3 | formerly Novagen |
| Anti-Flag HRP | Sigma | A8592 | |
| Anti-CFTR IgG | Custom-made | R1104 | mAb recognizing CFTR epitope at a.a. 722-734 |
| Anti-MRP2 IgG | Chemicon International | MAB4148 | Now a part of Millipore |
Table 2. Specific reagents and equipment.
References
- Anderson, M. P. Demonstration that CFTR is a chloride channel by alteration of its anion selectivity. Science. 253, 202-205 (1991).
- Bear, C. E. Purification and functional reconstitution of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR. Cell. 68, 809-818 (1992).
- Quinton, P. M. Chloride impermeability in cystic fibrosis. Nature. 301, 421-422 (1983).
- Cheng, S. H. Defective intracellular transport and processing of CFTR is the molecular basis of most cystic fibrosis. Cell. 63, 827-834 (1990).
- Gabriel, S. E., Brigman, K. N., Koller, B. H., Boucher, R. C., Stutts, M. J. Cystic fibrosis heterozygote resistance to cholera toxin in the cystic fibrosis mouse model. Science. 266, 107-109 (1994).
- Li, C., Naren, A. P. CFTR chloride channel in the apical compartments: spatiotemporal coupling to its interacting partners. Integr. Biol (Camb). 2, 161-177 (2010).
- Chao, A. C. Activation of intestinal CFTR Cl- channel by heat-stable enterotoxin and guanylin via cAMP-dependent protein kinase. Embo. J. 13, 1065-1072 (1994).
- Gabriel, S. E., Clarke, L. L., Boucher, R. C., Stutts, M. J. CFTR and outward rectifying chloride channels are distinct proteins with a regulatory relationship. Nature. 363, 263-268 (1993).
- McNicholas, C. M. Sensitivity of a renal K+ channel (ROMK2) to the inhibitory sulfonylurea compound glibenclamide is enhanced by coexpression with the ATP-binding cassette transporter cystic fibrosis transmembrane regulator. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93, 8083-8088 (1996).
- Schreiber, R., Nitschke, R., Greger, R., Kunzelmann, K. The cystic fibrosis transmembrane conductance regulator activates aquaporin 3 in airway epithelial cells. J. Biol. Chem. 274, 11811-11816 (1999).
- Shumaker, H., Amlal, H., Frizzell, R., Ulrich, C. D., Soleimani, M. CFTR drives Na+-nHCO-3 cotransport in pancreatic duct cells: a basis for defective HCO-3 secretion in CF. Am. J. Physiol. 276, 16-25 (1999).
- Ahn, W. Regulatory interaction between the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator and HCO3- salvage mechanisms in model systems and the mouse pancreatic duct. J. Biol. Chem. 276, 17236-17243 (2001).
- Sugita, M., Yue, Y., Foskett, J. K. CFTR Cl- channel and CFTR-associated ATP channel: distinct pores regulated by common gates. Embo. J. 17, 898-908 (1998).
- Naren, A. P. Regulation of CFTR chloride channels by syntaxin and Munc18 isoforms. Nature. 390, 302-305 (1997).
- Naren, A. P. Syntaxin 1A is expressed in airway epithelial cells, where it modulates CFTR Cl(-) currents. J. Clin. Invest. 105, 377-386 (2000).
- Naren, A. P. A macromolecular complex of beta 2 adrenergic receptor, CFTR, and ezrin/radixin/moesin-binding phosphoprotein 50 is regulated by PKA. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100, 342-346 (1073).
- Li, C. Lysophosphatidic acid inhibits cholera toxin-induced secretory diarrhea through CFTR-dependent protein interactions. J. Exp. Med. 202, 975-986 (2005).
- Li, C. Spatiotemporal coupling of cAMP transporter to CFTR chloride channel function in the gut epithelia. Cell. 131, 940-951 (2007).
- Li, C., Schuetz, J. D., Naren, A. P. Tobacco carcinogen NNK transporter MRP2 regulates CFTR function in lung epithelia: implications for lung cancer. Cancer Lett. 292, 246-253 (2010).
- Hall, R. A. A C-terminal motif found in the beta2-adrenergic receptor, P2Y1 receptor and cystic fibrosis transmembrane conductance regulator determines binding to the Na+/H+ exchanger regulatory factor family of PDZ proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95, 8496-8501 (1998).
- Short, D. B. An apical PDZ protein anchors the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator to the cytoskeleton. J. Biol. Chem. 273, 19797-19801 (1998).
- Wang, S., Yue, H., Derin, R. B., Guggino, W. B., Li, M. Accessory protein facilitated CFTR-CFTR interaction, a molecular mechanism to potentiate the chloride channel activity. Cell. 103, 169-179 (2000).
- Sun, F. E3KARP mediates the association of ezrin and protein kinase A with the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator in airway cells. J. Biol. Chem. 275, 29539-29546 (2000).
- Cheng, J. A Golgi-associated PDZ domain protein modulates cystic fibrosis transmembrane regulator plasma membrane expression. J. Biol. Chem. 277, 3520-3529 (1074).
- Scott, R. O., Thelin, W. R., Milgram, S. L. A novel PDZ protein regulates the activity of guanylyl cyclase C, the heat-stable enterotoxin receptor. The Journal of biological chemistry. 277, 22934-22941 (1074).
- Lee, J. H. Dynamic regulation of cystic fibrosis transmembrane conductance regulator by competitive interactions of molecular adaptors. The Journal of biological chemistry. 282, 10414-10422 (2007).
- Gee, H. Y., Noh, S. H., Tang, B. L., Kim, K. H., Lee, M. G. Rescue of DeltaF508-CFTR trafficking via a GRASP-dependent unconventional secretion pathway. Cell. 146, 746-760 (2011).
- Naren, A. P. Methods for the study of intermolecular and intramolecular interactions regulating CFTR function. Met. Molecul. Med. 70, 175-186 (2002).
- Li, C., Roy, K., Dandridge, K., Naren, A. P. Molecular assembly of cystic fibrosis transmembrane conductance regulator in plasma membrane. The Journal of biological chemistry. 279, 24673-24684 (2004).
- Li, C., Naren, A. P. Analysis of CFTR Interactome in the Macromolecular Complexes. Met. Molecul. Med. 741, 255-270 (2011).
- Wu, Y. A chemokine receptor CXCR2 macromolecular complex regulates neutrophil functions in inflammatory diseases. J. Biol. Chem. , (2011).
