Summary

Kromosom Forberedelse Fra dyrkede celler

Published: January 28, 2014
doi:

Summary

Kromosomer kan bli isolert fra levende celler slik som lymfocytter eller hudfibroblaster, og fra organismer inkludert mennesker eller mus. Disse kromosompreparater kan videre benyttes for rutinemessig G-banding og molekylære cytogenetiske prosedyrer som for eksempel fluorescens in situ hybridisering (FISH), komparativ genomisk hybridisering (CGH), og spektral karyotyping (SKY).

Abstract

Kromosom (cytogenetisk) analyse er mye brukt for påvisning av kromosom ustabilitet. Ved etterfulgt av G-striper og molekylære teknikker som fluorescens in situ hybridisering (FISH), har denne analysen den kraftige evne til å analysere de enkelte celler for forstyrrelser som involverer gevinster eller tap av deler av genomet, og rearrangementer som omfatter en eller flere kromosomer. Hos mennesker, kromosomfeil forekommer hos ca 1 pr 160 levendefødte 1,2, 60-80% av alle spontanaborter 3,4, 10% av dødfødsler 2,5, 13% av personer med medfødt hjertesykdom 6, 3-6% av ufruktbarhet tilfeller to, og i mange pasienter med forsinket utvikling og fødselsskader 7. Cytogenetisk analyse av malignitet er rutinemessig brukt av forskere og klinikere, som observasjoner av klonale kromosomavvik har vist seg å ha både diagnostisk og prognostisk betydning 8,9.60; Kromosom isolasjon er uvurderlig for genterapi og stamcelleforskning organismer, inkludert ikke-menneskelige primater og gnagere 10-13.

Kromosomer kan bli isolert fra celler av levende vev, inkludert blod-lymfocytter, hudfibroblaster, amniocytes, placenta, benmargen, og vevsprøver. Kromosomene er analysert ved meta stadium av mitose, når de er mest kondensert og derfor mer synlig. Det første trinn i kromosomet isolasjon teknikken innebærer oppbrytning av spindefibre ved inkubasjon med Colcemid, for å hindre at celler fra å gå frem til det etterfølgende anaphase stadium. Cellene blir deretter behandlet med en hypoton løsning og bevart i sin utvidete form med Carnoy sin fikseringsmiddel. Cellene blir deretter slippes på ved sidene, og kan deretter benyttes for en rekke prosedyrer. G-banding omfatter trypsin behandling etterfulgt av farging med Giemsa å skape karakteristisk lys og mørke striper. Den samme procedure å isolere kromosomer kan anvendes for fremstilling av celler for prosedyrer som for eksempel fluorescens in situ hybridisering (FISH), komparativ genomisk hybridisering (CGH) og spektral karyotyping (SKY) 14,15.

Introduction

Kromosomanalyse er en konvensjonell teknikk benyttes over hele verden til å diagnostisere kromosom ustabilitet og rearrangements fører til genetiske lidelser og malignitet 1,2,8,9. I tillegg kan en høyere oppløsning for diagnose og forskning av konstitusjonelle og kreft-ervervet genetiske avvik oppnås med en kombinasjon av de klassiske cytogenetiske prosedyrer og molekylære cytogenetiske metoder som fluorescens in situ hybridisering (FISH), komparativ genomisk hybridisering (CGH) , og spektral karyotyping (SKY) 14,15. I den senere tid har disse teknikker blitt benyttet for evaluering av kromosom ustabilitet forbundet med stamceller. Karyotypic abnormaliteter som aneuploidy av langsiktige dyrkede embryonale celler (ES) og voksne stamceller av ulike organismer har blitt rapportert av flere laboratorier. Nyere bevis støtter at noen cellelinjer er iboende mer tilbøyelig til kromosom instabiLity uavhengig av kultur forhold. Av denne grunn, ved å etablere og / eller opprettholde menneske, mus eller Rhesus stamcellelinjer, er kromosom analyse anbefalt som en del av kvalitetskontrollen. Mange rapporter beskriver den økende interesse for bruk av rutinemessige og molekylære cytogenetikk å overvåke det kromosomale stabiliteten av stamceller og maligne celler eller forskjellige organismer i kulturen 10-13. Disse protokollene er i økende grad blir brukt av nongenetic laboratorier for rask kromosom vurdering av sine dyrkede celler 13. Vi presenterer våre grunnleggende prosedyrer for kromosom forberedelse fra ulike celletyper, som kan brukes for både klinisk og forskningsformål og celler som stammer fra ulike organismer.

Protocol

En. Kromosom Høsting av heftende celler Standard protokoll Grow celler i henhold til bestemte celledyrking forhold. Når cellene har nådd logaritmisk fase (80% konfluens), tilsett 10 ul / ml av Colcemid til cellekulturkolbe. Et minimum på 2 x 10 celler 6 er anbefalt. Inkuber cellene ved 37 ° C i en 5% CO2-inkubator i 45 min. Ved hjelp av en steril pipette, overføre media fra cellene til en 15 ml konisk tube. Sett til side. Forsiktig vask…

Representative Results

Høy kvalitet metafase spreads er avgjørende for kromosomanalyse. En vellykket analysen gir kromosomer som er godt spredt og av egnet kromosom morfologi. Riktig G-båndede kromosomer inneholder den karakteristiske lyse og mørke båndmønstrene. Figur 1. Vellykket kromosomal spredning hvori kromosome…

Discussion

Vi har benyttet dagens prosedyre for kromosom isolert fra celler av ulike organismer, inkludert ulike celletyper hentet fra menneske, rhesus-aper, rotter og mus 11,20-22. Standarden protokollen er gitt, men enkelte viktige skritt og variabler kan være nødvendig å justere for disse ulike typer celler. Flere konkrete tiltak er avgjørende både i kromosom forberedelse og G-banding for å sikre best mulig kvalitet på resultatene. En av de variable som kan påvirke analysen, er den Colcemid inkubasjonstid. Ut…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Arbeidet er beskrevet i dette manuskriptet ble gjort mulig ved midler fra Patrick F. Taylor Foundation.

Materials

KaryoMAX Colcemid Gibco 15212-012
HBSS Buffer Gibco 24020-117
0.5% Trypsin EDTA 10x Gibco 15400-054
Permount Fisher Scientific SP15-100
Buffer Tablets "GURR" Gibco 10580-013
Geimsa Stain Ricca Chemical Company 3250-16
Centrifuge 5810 Eppendorf
Methanol Caledon Laboratory Chemicals 6700130
Glacial Acetic Acid Krackeler Scientific Inc.  11-9508-05

References

  1. Driscoll, D., Gross, S. Prenatal screening for aneuploidy. New Engl. J. Med. 360, 2556-2562 (2009).
  2. Nussbuam, R., et al. . Genetics in Medicine: 7th Edition. , 76 (2007).
  3. Ljunger, E., et al. Chromosomal abnormalities in first-trimester miscarriages. Acta Obstet. Gynecol. Scand. 84 (11), 1103-1107 (2005).
  4. Kwinecka-Dmitri, B., et al. Frequency of chromosomal aberrations in material from abortions. Ginecol. Pol. 81 (12), 896-901 (2010).
  5. Reddy, U., et al. Stillbirth classification—Developing an international consensus for research: Executive summary of a national institute of child health and human development workshop. Obstet. Gynecol. 114 (4), 901-914 (2009).
  6. Pierpoint, M., et al. Genetic basis for congenital heart defects: Current knowledge. Circulation. 115 (23), 3015 (2007).
  7. Kaneshiro, N., Zieve, D. Down Syndrome: Trisomy 21.. PubMed Health. , (2010).
  8. Cin, P. D. . Current Protocols in Human Genetics. , (2003).
  9. Wang, N. Methodologies in cancer cytogenetics and molecular cytogenetics. Am. J. Med. Genet. 115 (3), 118-124 (2002).
  10. Miura, M., et al. Accumulated Chromosomal Instability in Murine Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells Leads to Malignant Transformation. Stem Cells. 24 (4), 1095-1103 (2006).
  11. Izadpanah, R., et al. Long-term In vitro Expansion Alters the Biology of Adult Mesenchymal Stem Cells. Cancer Res. 68 (11), 4229-4238 (2008).
  12. Dekel-Naftali, M., et al. Screening of human pluripotent stem cells using CGH and FISH reveals low-grade mosaic aneuploidy and a recurrent amplification of chromosome 1q. Eur. J. Hum. Genet. 20 (12), 1248-1255 (2012).
  13. Moralli, D., Yusuf, M., Mandegar, M., Khoja, S., Monaco, Z. L., Volpi, E. An Improved Technique for Chromosomal Analysis of Human ES and iPS Cells. Stem Cell Rev. Rep. 7 (2), 471-477 (2011).
  14. Bayani, J., Squire, J. Traditional banding of chromosomes for cytogenetic analysis. Curr. Protoc. Cell Biol. 22, (2004).
  15. Speicher, M. R., Carter, N. P. The new cytogenetics: blurring the boundaries with molecular biology. Nat. Rev. Genet. 6 (10), 782-792 (2005).
  16. Benn, P., Delach, J. Human Lymphocyte Culture and Chromosome Analysis. Cold Spring Harb Protoc. , (2010).
  17. Muul, L. M., Heine, G., Silvin, C., James, S. P., Candotti, F., Radbruch, A., Worm, M. . Measurement of Proliferative Responses of Cultured Lymphocytes, Curr. Protoc. Immunol. , (2011).
  18. Barch, M. J., Knutsen, T., Spurbeck, J. . The Association of Genetic Technologists Cytogenetics Laboratory Manual. San Francisco: 3rd edition. , (1997).
  19. Dewald, G. W., Ketterling, R. P., Wyatt, W. A., Stupca, P. J., McClatchey, K. D. Cytogenetic studies in neoplastic hematologic disorders. In Clinical Laboratory Medicine, 2nd edition. , 658-685 (2002).
  20. Kibe, R., et al. IL-7Rα deficiency in p53(null) mice exacerbates thymocyte telomere erosion and lymphomagenesis. Cell Death Different. 19 (7), 1139-1151 (2012).
  21. Tsien, F., Morava, E., Talarski, A., Marble, M. Phenotypic features of a boy with trisomy of 16q22–>qter due to paternal Y; 16 translocation. Clin. Dysmorphol. 4 (4), 177-181 (2005).
  22. Tsien, F., et al. Prolonged culture of normal chorionic villus cells yields ICF syndrome-like chromatin decondensation and rearrangements. Cytogenet. Genome Res. 8 (1), 13-21 (2002).
  23. McGrattan, P., Campbell, S., Cuthbert, R., Jones, F., McMullin, M., Humphreys, M. Integration of conventional cytogenetics (G-banding), comparative genomic hybridization (CGH) and interphase fluorescence in situ hybridization (i-FISH) for the detection of genomic rearrangements in acute leukemia. J. Clin. Pathol. 61 (8), 903-908 (2008).
check_url/50203?article_type=t&slug=chromosome-preparation-from-cultured-cells

Play Video

Cite This Article
Howe, B., Umrigar, A., Tsien, F. Chromosome Preparation From Cultured Cells. J. Vis. Exp. (83), e50203, doi:10.3791/50203 (2014).

View Video