Summary

Interaktioner med og membran Permeabilisering af hjernen mitochondrier af amyloid Fibrils

Published: September 28, 2019
doi:

Summary

Forudsat her er en protokol til at undersøge samspillet mellem Native form, prefibrillar, og modne amyloid fibriller af forskellige peptider og proteiner med mitokondrier isoleret fra forskellige væv og forskellige områder af hjernen.

Abstract

En voksende mængde af beviser indikerer, at membran permeabilisering, herunder interne membraner såsom mitokondrier, er et fælles træk og primære mekanisme af amyloid aggregat-induceret toksicitet i neurodegenerative sygdomme. Men de fleste rapporter, der beskriver mekanismerne for membran afbrydelse er baseret på phospholipid modelsystemer, og undersøgelser direkte rettet mod hændelser, der forekommer på niveauet af biologiske membraner er sjældne. Beskrevet her er en model til undersøgelse af mekanismerne for amyloid toksicitet på membran niveau. For mitokondriel isolering anvendes tæthed gradient medium til at opnå præparater med minimal myelin forurening. Efter bekræftelse af mitokondriel membran integritet er samspillet mellem amyloid fibriller, der hidrører fra α-synuclein, bovin insulin, og høne æggehvide lysozym (hewl) med rotte hjernen mitokondrier, som en in vitro biologisk model, undersøgt. Resultaterne viser, at behandling af hjernen mitokondrier med fibrillar forsamlinger kan forårsage forskellige grader af membran permeabilization og ROS indhold ekstraudstyr. Dette indikerer struktur afhængige interaktioner mellem amyloid fibriller og mitokondriel membran. Det foreslås, at biofysiske egenskaber af amyloid fibriller og deres specifikke binding til mitokondrielle membraner kan give forklaringer på nogle af disse observationer.

Introduction

Amyloid-relaterede lidelser, kendt som amyloidoser, udgør en stor gruppe af sygdomme defineret ved fremkomsten af uopløselige protein aflejringer i forskellige væv og organer1,2. Blandt dem er neurodegenerative lidelser de hyppigst anvendte former, hvor protein aggregater optræder i det centrale eller perifere nervesystem2. Selv om en række mekanismer er blevet foreslået at være involveret i toksiciteten af amyloid aggregater3, en voksende mængde af beviser peger på celle membran afbrydelse og permeabilisering som den primære mekanisme af amyloid patologi4, 5. Ud over plasma membran, interne organeller (dvs., mitochondrier) kan også blive påvirket.

Interessant, nye beviser tyder på, at mitokondriel dysfunktion spiller en afgørende rolle i patogenesen af neurodegenerative lidelser, herunder Alzheimers og Parkinsons sygdomme6,7. I overensstemmelse med dette spørgsmål har talrige rapporter indikeret binding og akkumulering af amyloid β-peptid, α-synuclein, huntingtin og Als-sammenkædede mutant SOD1 proteiner til mitokondrier8,9,10, 11. mekanismen for membran permeabilisering ved amyloid aggregater menes at forekomme enten gennem dannelse af diskrete kanaler (porer) og/eller gennem en ikke-specifik vaskemiddel lignende mekanisme5,12, 13. Det er bemærkelsesværdigt, at de fleste af disse konklusioner har været baseret på rapporter, der involverer phospholipid modelsystemer, og undersøgelser direkte rettet mod de hændelser, der forekommer i biologiske membraner er sjældne. Det er klart, disse kunstige lipid dobbeltlag ikke nødvendigvis afspejler de iboende egenskaber af biologiske membraner, herunder de af mitokondrier, som er heterogene strukturer og består af en bred vifte af phospholipider og proteiner.

I nærværende undersøgelse anvendes mitokondrier isoleret fra rotte hjerner som en in vitro biologisk model til at undersøge de ødelæggende virkninger af amyloid fibriller, der opstår som følge af α-synuclein (som et monomer protein), bovin insulin (som et model peptid, som viser signifikant strukturel homologi med humant insulin involveret i injektion-lokaliseret amyloidose), og høne æggehvide lysozym (HEWL; som en fælles model protein til undersøgelse af amyloid sammenlægning). Interaktioner og mulige skader af mitokondrie membraner induceret af amyloid fibriller er derefter undersøgt ved at observere frigivelsen af mitokondrie Malate dehydrogenase (MDH) (placeret i mitokondrie matrix) og mitokondrier reaktiv ilt art (ROS) ekstraudstyr.

Protocol

Alle dyreforsøg blev udført i overensstemmelse med den institutionelle dyrepleje og brug Komité (IACUC) af medicinske videnskaber på Teheran Universitet. Der blev gjort en maksimal indsats for at minimere lidelser og skadelige virkninger for rotterne ved at skærpe guillotine bladene og anvende knivene resolut og hurtigt. 1. hjernens homogenisering og mitokondriel isolation Bemærk: alle reagenser til mitokondriel isolation blev udarbejdet i henhold til Sims og An…

Representative Results

Protokollen beskriver en model til at studere interaktioner af amyloid og med rotte hjernen mitokondrier som en in vitro biologisk model. For mitokondriel præparat, 15% (v/v) tæthed gradient medium blev brugt til at fjerne myelin som større forurening af hjernevæv14. Som vist i figur 1aproducerede centrifugering ved 30.700 x g to særskilte materiale bånd, myelin (som den vigtigste bestanddel af band 1) og band 2, so…

Discussion

Et væld af eksperimentelle resultater understøtter hypotesen om, at cytotoksicitet af fibrillar aggregater er væsentligt forbundet med deres evne til at interagere med og permeabilize biologiske membraner4,5. Men de fleste af dataene er baseret på kunstige lipid-dobbeltlag, der ikke nødvendigvis afspejler de iboende egenskaber af biologiske membraner, som er heterogene strukturer med en bred vifte af phospholipider og proteiner. Her, ved hjælp af hjernen mi…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Dette arbejde blev støttet af tilskud fra Forskningsrådet under instituttet for avancerede studier i grundlæggende videnskaber (IASBS), Zanjan, Iran.

Materials

2′,7′-Dichlorodihydrofluorescein diacetate Sigma 35845
Ammonium sulfate Merck 1012171000
Black 96-well plate Corning
Black Clear-bottomed 96-well plate Corning
Bovine insulin Sigma I6634
Bovine Serum Albumin (BSA) Sigma A2153
BSA essentially fatty acid-free Sigma A6003
Centrifuge Sigma
Crystal clear sealing tape Corning
CuSO4 Sigma 451657
Dialysis bag (cut off 2 KDa) Sigma D2272
Dounce homogenizer Potter Elvehjem
EDTA Sigma E9884
Fluorescence plate reader BioTek
Fluorescence spectrophotometer Cary Eclipse VARIAN
Folin Merck F9252
Glycine Sigma G7126
Guillotine Made in Iran
HCl Merck H1758
Hen Egg White Lysozyme (HEWL) Sigma L6876
Na2CO3 Sigma S7795
NaH2PO4 Sigma S7907
NaOH Merck S8045
Oxaloacetate Sigma O4126
Percoll GE Healthcare
Phosphate Buffer Saline (PBS) Sigma CS0030
PMSF Sigma P7626
Potassium sodium tartrate Sigma 217255
Quartz cuvette Sigma
Spectrophotometer analytik jena SPEKOL 2000 model
Succinate Sigma S2378
Sucrose Merck 1076871000
Thermomixer Eppendorph
Thioflavin T Sigma T3516
Tris-HCl Merck 1082191000
Triton X-100 Sigma T9284
Tryptone QUELAB
Water bath Memmert
Yeast Extract QUELAB
β-NADH Sigma N8129

References

  1. Merlini, G., Bellotti, V. Molecular mechanisms of amyloidosis. New England Journal of Medicine. 349, 583-596 (2003).
  2. Berg, I. . Modeling amyloid disease in Drosophila melanogaster, Linköping Studies in Science and Technology Dissertation No. 1320. , (2010).
  3. Kagan, B. L., Uversky, V. N., Fink, A. L. Protein aggregation, ion channel formation, and membrane damage. Protein Misfolding, Aggregation, and Conformational Diseases. , 223-236 (2006).
  4. Demuro, A., et al. Calcium dysregulation and membrane disruption as a ubiquitous neurotoxic mechanism of soluble amyloid oligomers. The Journal of Biological Chemistry. 280, 17294-17300 (2005).
  5. Kayed, R., et al. Permeabilization of lipid bilayers is a common conformation-dependent activity of soluble amyloid oligomers in protein misfolding diseases. The Journal of Biological Chemistry. 279, 46363-46366 (2004).
  6. Manczak, M., Park, B. S., Jung, Y., Reddy, P. H. Differential expression of oxidative phosphorylation genes in patients with Alzheimer’s disease: implications for early mitochondrial dysfunction and oxidative damage. Neuromolecular Medicine. 5, 147-162 (2004).
  7. Vila, M., Ramonet, D., Perier, C. Mitochondrial alterations in Parkinson’s disease: new clues. Journal of Neurochemistry. 107, 317-328 (2008).
  8. Petersen, C. A. H., et al. The amyloid β-peptide is imported into mitochondria via the TOM import machinery and localized to mitochondrial cristae. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 13145-13150 (2008).
  9. Devi, L., Raghavendran, V., Prabhu, B. M., Avadhani, N. G., Anandatheerthavarada, H. K. Mitochondrial import and accumulation of α-synuclein impair complex I in human dopaminergic neuronal cultures and Parkinson disease brain. The Journal of Biological Chemistry. 283, 9089-9100 (2008).
  10. Costa, V., Scorrano, L. Shaping the role of mitochondria in the pathogenesis of Huntington’s disease. EMBO Journal. 31, 1853-1864 (2012).
  11. Vande Velde, C., Miller, T. M., Cashman, N. R., Cleveland, D. W. Selective association of misfolded ALS-linked mutant SOD1 with the cytoplasmic face of mitochondria. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 4022-4027 (2008).
  12. Kagan, B. L., Azimov, R., Azimova, R. Amyloid peptide channels. The Journal of Membrane Biology. 202, 1-10 (2004).
  13. Lashuel, H. A., Hartley, D., Petre, B. M., Walz, T., Lansbury, P. T. Neurodegenerative disease: amyloid pores from pathogenic mutations. Nature. 418, 291 (2002).
  14. Sims, N. R., Anderson, M. F. Isolation of mitochondria from rat brain using Percoll density gradient centrifugation. Nature Protocols. 3, 1228-1239 (2008).
  15. Ghobeh, M., et al. Interaction of Aβ (25-35) Fibrillation Products with Mitochondria: Effect of Small-Molecule Natural Products. Peptide Science. 102, 473-486 (2014).
  16. Lowry, O. H., Rosebrough, N. J., Farr, A. L., Randall, R. J. Protein measurement with the folin phenol reagent. The Journal of Biological Chemistry. 193, 265-275 (1951).
  17. Sottocasa, G. L., Kuylenstierna, B., Ernester, L., Bergstrand, A. Separation and some enzymatic properties of the inner and outer membrane of rat liver mitochondria. Methods in Enzymology. 10, 448-463 (1967).
  18. Hoyer, W., et al. Dependence of a-Synuclein Aggregate Morphology on Solution Conditions. Journal of Molecular Biology. 322, 383-393 (2002).
  19. Weinreb, P. H., et al. NACP, a protein implicated in Alzheimer’s disease and learning, is natively unfolded. Biochemistry. 35, 13709-13715 (1996).
  20. Porter, R. R. Partition chromatography of insulin and other proteins. The Biochemical Journal. 53, 320-328 (1953).
  21. Goldberg, M. E., Rudolph, R., Jaenicke, R. A kinetic study of the competition between renaturation and aggregation during the refolding of denatured reduced egg white lysozyme. Biochemistry. 30, 2790-2797 (1991).
  22. Young, T. A., Cunningham, C. C., Bailey, S. M. Reactive oxygen species production by the mitochondrial respiratory chain in isolated rat hepatocytes and liver mitochondria: studies using myxothiazol. Archives of Biochemistry and Biophysics. 405, 65-72 (2002).
  23. Meratan, A. A., Ghasemi, A., Nemat-Gorgani, M. Membrane integrity and amyloid cytotoxicity: a model study involving mitochondria and lysozyme fibrillation products. Journal of Molecular Biology. 409, 826-838 (2011).
  24. Katebi, B., Mahdavimehr, M., Meratan, A. A., Ghasemi, A., Nemat-Gorgani, M. Protective effects of silibinin on insulin amyloid fibrillation, cytotoxicity and mitochondrial membrane damage. Archives of Biochemistry and Biophysics. 659, 22-32 (2018).
  25. Fink, A. L. The aggregation and fibrillation of alpha-synuclein. Accounts of Chemical Research. 39, 628-634 (2006).
  26. Diraviyam, K., Stahelin, R. V., Cho, W., Murray, D. Computer modeling of the membrane interaction of FYVE domains. Journal of Molecular Biology. 328, 721-736 (2003).
  27. Van Rooijen, B. D., Claessens, M., Subramaniam, V. Lipid bilayer disruption by oligomeric α-synuclein depends on bilayer charge and accessibility of the hydrophobic core. Biochimica et Biophysica Acta. 1788, 1271-1278 (2009).
  28. Kourie, J. I., Henry, C. L. Ion channel formation and membrane-linked pathologies of misfolded hydrophobic proteins: the role of dangerous unchaperoned molecules. Clinical and Experimental Pharmacology & Physiology. 29, 741-753 (2002).
  29. Bucciantini, M., et al. Inherent toxicity of aggregates implies a common mechanism for protein misfolding diseases. Nature. 416, 507-511 (2002).
  30. Bolognesi, B., et al. ANS binding reveals common features of cytotoxic amyloid species. ACS Chemical Biology. 5, 735-740 (2010).
  31. Posse, E., De Arcuri, B. F., Morero, R. D. Lysozyme interactions with phospholipid vesicles: relationships with fusion and release of aqueous content. Biochimica et Biophysica Acta. 1193, 101-106 (1994).
  32. Roqanian, S., et al. Polyphenols protect mitochondrial membrane against permeabilization induced by HEWL oligomers: possible mechanism of action. International Journal of Biological Macromolecules. 103, 709-720 (2017).
  33. Ulmer, T. S., Bax, A., Cole, N. B., Nussbaum, R. L. Structure and dynamics of micelle-bound human alphasynuclein. The Journal of Biological Chemistry. 280, 9595-9603 (2005).
  34. Stockl, M., Fischer, P., Wanker, E., Herrmann, A. Alpha-synuclein selectively binds to anionic phospholipids embedded in liquid-disordered domains. Journal of Molecular Biology. 375, 1394-1404 (2008).
  35. Devi, L., et al. Mitochondrial import and accumulation of α-synuclein impair complex I in human dopaminergic neuronal cultures and Parkinson disease brain. The Journal of Biological Chemistry. 283, 9089-9100 (2008).
  36. Ghio, S., Kamp, F., Cauchi, R., Giese, A., Vassallo, N. Interaction of α-synuclein with biomembranes in Parkinson’s disease-role of cardiolipin. Progress in Lipid Research. 61, 73-82 (2016).
  37. Petersen, C. A. H., et al. The amyloid β-peptide is imported into mitochondria via the TOM import machinery and localized to mitochondrial cristae. Proceedings of National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 13145-13150 (2008).
  38. Costa, V., Scorrano, L. Shaping the role of mitochondria in the pathogenesis of Huntington’s disease. EMBO Journal. 31, 1853-1864 (2012).
  39. Vande Velde, C., Miller, T. M., Cashman, N. R., Cleveland, D. W. Selective association of misfolded ALS-linked mutant SOD1 with the cytoplasmic face of mitochondria. Proceedings of National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 4022-4027 (2008).
  40. Oladzad Abbasabadi, A., et al. Disruption of mitochondrial membrane integrity induced by amyloid aggregates arising from variants of SOD1. International Journal of Biological Macromolecules. 61, 212-217 (2013).

Play Video

Cite This Article
Zadali, R., Ghareghozloo, E. R., Ramezani, M., Hassani, V., Rafiei, Y., Chiyaneh, S. M., Meratan, A. A. Interactions with and Membrane Permeabilization of Brain Mitochondria by Amyloid Fibrils. J. Vis. Exp. (151), e59883, doi:10.3791/59883 (2019).

View Video