Summary

एमीलॉयड फाइब्रिल्स द्वारा मस्तिष्क माइटोकोंड्रिया के साथ और झिल्ली permeabilization के साथ बातचीत

Published: September 28, 2019
doi:

Summary

लेकिन यहाँ देशी फार्म के बीच बातचीत की जांच के लिए एक प्रोटोकॉल है, prefibrillar, और विभिन्न पेप्टाइड्स और प्रोटीन के परिपक्व एमिलॉयड फाइब्रिल्स के साथ mitochondria विभिन्न ऊतकों और मस्तिष्क के विभिन्न क्षेत्रों से अलग.

Abstract

सबूत के एक बढ़ते शरीर इंगित करता है कि झिल्ली permeabilization, mitochondria जैसे आंतरिक झिल्ली सहित, एक आम विशेषता है और neurodegenerative रोगों में एमिलॉयड कुल प्रेरित विषाक्तता के प्राथमिक तंत्र है. हालांकि, झिल्ली व्यवधान के तंत्र का वर्णन सबसे रिपोर्ट फॉस्फोलिपिड मॉडल सिस्टम पर आधारित हैं, और अध्ययन सीधे जैविक झिल्ली के स्तर पर होने वाली घटनाओं को लक्षित दुर्लभ हैं. यहाँ वर्णित झिल्ली के स्तर पर एमिलॉयड विषाक्तता के तंत्र का अध्ययन करने के लिए एक मॉडल है. Mitochondrial अलगाव के लिए, घनत्व ढाल मध्यम न्यूनतम myelin संदूषण के साथ तैयारी प्राप्त करने के लिए प्रयोग किया जाता है. माइटोकोंड्रिल झिल्ली अखंडता की पुष्टि के बाद, एमिलॉयड फाइब्रिल की बातचीत जेड-साइनुक्लिइन, गोजातीय इंसुलिन, और मुर्गी अंडे सफेद lysozyme (HEWL) चूहे मस्तिष्क mitochondria के साथ से उत्पन्न होने वाली, एक इन विट्रो जैविक मॉडल के रूप में, जांच की है। परिणाम प्रदर्शित करता है कि फाइब्रिलर विधानसभाओं के साथ मस्तिष्क mitochondria के उपचार झिल्ली permeabilization और ROS सामग्री वृद्धि के विभिन्न डिग्री पैदा कर सकता है. यह एमिलॉयड फाइब्रिल्स और माइटोकोंड्रिल झिल्ली के बीच संरचना-निर्भर अन्योन्यक्रिया को इंगित करता है। यह सुझाव दिया जाता है कि एमिलॉयड फाइब्रिल्स के जैवभौतिक गुण और माइटोकोंड्रिल झिल्ली के लिए उनकी विशिष्ट बाइंडिंग इन प्रेक्षणों में से कुछ के लिए स्पष्टीकरण प्रदान कर सकती है।

Introduction

एमिलॉयड से संबंधित विकार, जिसे एमिलॉयडोस के रूप में जाना जाता है, विभिन्न ऊतकों और अंगों में अघुलनशील प्रोटीन जमा की उपस्थिति द्वारा परिभाषित रोगों का एक बड़ा समूह का गठन1,2. उनमें से, neurodegenerative विकार सबसे अक्सर रूपों में जो प्रोटीन समुच्चय केंद्रीय या परिधीय तंत्रिका तंत्र2में दिखाई देते हैं. हालांकि एमिलॉयड समुच्चय3की विषाक्तता में शामिल होने के लिए कई तंत्रों का प्रस्ताव किया गया है , एमिलॉयड पैथोलॉजी4के प्राथमिक तंत्र के रूप में कोशिका झिल्ली विघटन और permebilization के लिए सबूत की बढ़ती शरीर, 5. प्लाज्मा झिल्ली के अलावा, आंतरिक organelles (यानी, mitochondria) भी प्रभावित हो सकता है.

दिलचस्प है, उभरते सबूत पता चलता है कि mitochondrial रोग neurodegenerative विकारों के रोगजनन में एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है, अल्जाइमर और पार्किंसंस रोगों सहित6,7. इस मुद्दे के अनुसार, कई रिपोर्टों ने एमिलॉयड जेड-पेप्टाइड, जेड-सिनयूक्लिइन, हंटिंगटिन, और एएलएस से जुड़े उत्परिवर्ती SOD1 प्रोटीन के बंधन और संचय को माइटोकोंड्रिया8,9,10, 11.एमिलॉयड समुच्चय द्वारा झिल्ली परमीबिलाइजेशन की क्रियाविधि या तो असतत चैनलों के गठन के माध्यम से माना जाता है (पोर) और/या एक गैर विशिष्ट डिटर्जेंट की तरह तंत्र के माध्यम से5,12, 13. यह उल्लेखनीय है कि इन निष्कर्षों के अधिकांश फॉस्फोलिपिड मॉडल सिस्टम से जुड़े रिपोर्ट पर आधारित किया गया है, और अध्ययन सीधे जैविक झिल्ली में होने वाली घटनाओं को लक्षित दुर्लभ हैं. जाहिर है, इन कृत्रिम लिपिड bilayers जरूरी जैविक झिल्ली के आंतरिक गुणों को प्रतिबिंबित नहीं, mitochondria के उन सहित, जो विषम संरचनाओं रहे हैं और फॉस्फोलिपिड और प्रोटीन की एक विस्तृत विविधता से बना.

वर्तमान अध्ययन में, mitochondria चूहे दिमाग से अलग एक इन विट्रो जैविक मॉडल के रूप में उपयोग किया जाता है के लिए amyloid फाइब्रिल्स के विनाशकारी प्रभाव की जांच करने के लिए जेड-synuclein से उत्पन्न होने वाले (एक एमिलॉयडप्रोटीन प्रोटीन के रूप में), गोजातीय इंसुलिन (एक मॉडल पेप्टाइड दिखा के रूप में) इंजेक्शन-स्थानीयकृत एमिलॉयडोसिस में शामिल मानव इंसुलिन के साथ महत्वपूर्ण संरचनात्मक होमोलोजी, और मुर्गी अंडे सफेद लाइसोजाइम (HEWL; एमिलॉयड एकत्रीकरण के अध्ययन के लिए एक आम मॉडल प्रोटीन के रूप में)। एमिलॉयड फाइब्रिल्स द्वारा प्रेरित माइटोकोंड्रियाल झिल्ली की बातचीत और संभावित क्षति की जांच माइटोकोंड्रियाल मैलेट डिहाइड्रोजेनेज (एमडीएच) (माइटोकोंड्रिल मैट्रिक्स में स्थित) और माइटोकोंड्रिया रिएक्टिव ऑक्सीजन की रिहाई को देखकर की जाती है। प्रजातियों (आरओएस) वृद्धि।

Protocol

सभी पशु प्रयोगों तेहरान विश्वविद्यालय के चिकित्सा विज्ञान के संस्थागत पशु देखभाल और उपयोग समिति (IACUC) के अनुसार प्रदर्शन किया गया. गिलोटिन ब्लेड sharpening और ब्लेड के दृढ़ और तेजी से आंदोलनों को लागू करने से ?…

Representative Results

प्रोटोकॉल एक इन विट्रो जैविक मॉडल के रूप में चूहे मस्तिष्क mitochondria के साथ एमिलॉयड फाइब्रिल की बातचीत का अध्ययन करने के लिए एक मॉडल का वर्णन करता है. माइटोकोंड्रियाल तैयारी के लिए, 15% (v/v) घनत्व प्रवणता माध्य?…

Discussion

प्रायोगिक परिणामों का धन इस परिकल्पना का समर्थन करता है कि फाइब्रिलर समुच्चयों की साइटोटॉक्सिसिटी जैविक झिल्ली4,5के साथ बातचीत करने और उनके साथ सहभागिता करने की क्षमता के साथ मह…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

इस काम को बुनियादी विज्ञान में उन्नत अध्ययन संस्थान की अनुसंधान परिषद (IASBS), ज़ंजन, ईरान से अनुदान द्वारा समर्थित किया गया था.

Materials

2′,7′-Dichlorodihydrofluorescein diacetate Sigma 35845
Ammonium sulfate Merck 1012171000
Black 96-well plate Corning
Black Clear-bottomed 96-well plate Corning
Bovine insulin Sigma I6634
Bovine Serum Albumin (BSA) Sigma A2153
BSA essentially fatty acid-free Sigma A6003
Centrifuge Sigma
Crystal clear sealing tape Corning
CuSO4 Sigma 451657
Dialysis bag (cut off 2 KDa) Sigma D2272
Dounce homogenizer Potter Elvehjem
EDTA Sigma E9884
Fluorescence plate reader BioTek
Fluorescence spectrophotometer Cary Eclipse VARIAN
Folin Merck F9252
Glycine Sigma G7126
Guillotine Made in Iran
HCl Merck H1758
Hen Egg White Lysozyme (HEWL) Sigma L6876
Na2CO3 Sigma S7795
NaH2PO4 Sigma S7907
NaOH Merck S8045
Oxaloacetate Sigma O4126
Percoll GE Healthcare
Phosphate Buffer Saline (PBS) Sigma CS0030
PMSF Sigma P7626
Potassium sodium tartrate Sigma 217255
Quartz cuvette Sigma
Spectrophotometer analytik jena SPEKOL 2000 model
Succinate Sigma S2378
Sucrose Merck 1076871000
Thermomixer Eppendorph
Thioflavin T Sigma T3516
Tris-HCl Merck 1082191000
Triton X-100 Sigma T9284
Tryptone QUELAB
Water bath Memmert
Yeast Extract QUELAB
β-NADH Sigma N8129

References

  1. Merlini, G., Bellotti, V. Molecular mechanisms of amyloidosis. New England Journal of Medicine. 349, 583-596 (2003).
  2. Berg, I. . Modeling amyloid disease in Drosophila melanogaster, Linköping Studies in Science and Technology Dissertation No. 1320. , (2010).
  3. Kagan, B. L., Uversky, V. N., Fink, A. L. Protein aggregation, ion channel formation, and membrane damage. Protein Misfolding, Aggregation, and Conformational Diseases. , 223-236 (2006).
  4. Demuro, A., et al. Calcium dysregulation and membrane disruption as a ubiquitous neurotoxic mechanism of soluble amyloid oligomers. The Journal of Biological Chemistry. 280, 17294-17300 (2005).
  5. Kayed, R., et al. Permeabilization of lipid bilayers is a common conformation-dependent activity of soluble amyloid oligomers in protein misfolding diseases. The Journal of Biological Chemistry. 279, 46363-46366 (2004).
  6. Manczak, M., Park, B. S., Jung, Y., Reddy, P. H. Differential expression of oxidative phosphorylation genes in patients with Alzheimer’s disease: implications for early mitochondrial dysfunction and oxidative damage. Neuromolecular Medicine. 5, 147-162 (2004).
  7. Vila, M., Ramonet, D., Perier, C. Mitochondrial alterations in Parkinson’s disease: new clues. Journal of Neurochemistry. 107, 317-328 (2008).
  8. Petersen, C. A. H., et al. The amyloid β-peptide is imported into mitochondria via the TOM import machinery and localized to mitochondrial cristae. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 13145-13150 (2008).
  9. Devi, L., Raghavendran, V., Prabhu, B. M., Avadhani, N. G., Anandatheerthavarada, H. K. Mitochondrial import and accumulation of α-synuclein impair complex I in human dopaminergic neuronal cultures and Parkinson disease brain. The Journal of Biological Chemistry. 283, 9089-9100 (2008).
  10. Costa, V., Scorrano, L. Shaping the role of mitochondria in the pathogenesis of Huntington’s disease. EMBO Journal. 31, 1853-1864 (2012).
  11. Vande Velde, C., Miller, T. M., Cashman, N. R., Cleveland, D. W. Selective association of misfolded ALS-linked mutant SOD1 with the cytoplasmic face of mitochondria. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 4022-4027 (2008).
  12. Kagan, B. L., Azimov, R., Azimova, R. Amyloid peptide channels. The Journal of Membrane Biology. 202, 1-10 (2004).
  13. Lashuel, H. A., Hartley, D., Petre, B. M., Walz, T., Lansbury, P. T. Neurodegenerative disease: amyloid pores from pathogenic mutations. Nature. 418, 291 (2002).
  14. Sims, N. R., Anderson, M. F. Isolation of mitochondria from rat brain using Percoll density gradient centrifugation. Nature Protocols. 3, 1228-1239 (2008).
  15. Ghobeh, M., et al. Interaction of Aβ (25-35) Fibrillation Products with Mitochondria: Effect of Small-Molecule Natural Products. Peptide Science. 102, 473-486 (2014).
  16. Lowry, O. H., Rosebrough, N. J., Farr, A. L., Randall, R. J. Protein measurement with the folin phenol reagent. The Journal of Biological Chemistry. 193, 265-275 (1951).
  17. Sottocasa, G. L., Kuylenstierna, B., Ernester, L., Bergstrand, A. Separation and some enzymatic properties of the inner and outer membrane of rat liver mitochondria. Methods in Enzymology. 10, 448-463 (1967).
  18. Hoyer, W., et al. Dependence of a-Synuclein Aggregate Morphology on Solution Conditions. Journal of Molecular Biology. 322, 383-393 (2002).
  19. Weinreb, P. H., et al. NACP, a protein implicated in Alzheimer’s disease and learning, is natively unfolded. Biochemistry. 35, 13709-13715 (1996).
  20. Porter, R. R. Partition chromatography of insulin and other proteins. The Biochemical Journal. 53, 320-328 (1953).
  21. Goldberg, M. E., Rudolph, R., Jaenicke, R. A kinetic study of the competition between renaturation and aggregation during the refolding of denatured reduced egg white lysozyme. Biochemistry. 30, 2790-2797 (1991).
  22. Young, T. A., Cunningham, C. C., Bailey, S. M. Reactive oxygen species production by the mitochondrial respiratory chain in isolated rat hepatocytes and liver mitochondria: studies using myxothiazol. Archives of Biochemistry and Biophysics. 405, 65-72 (2002).
  23. Meratan, A. A., Ghasemi, A., Nemat-Gorgani, M. Membrane integrity and amyloid cytotoxicity: a model study involving mitochondria and lysozyme fibrillation products. Journal of Molecular Biology. 409, 826-838 (2011).
  24. Katebi, B., Mahdavimehr, M., Meratan, A. A., Ghasemi, A., Nemat-Gorgani, M. Protective effects of silibinin on insulin amyloid fibrillation, cytotoxicity and mitochondrial membrane damage. Archives of Biochemistry and Biophysics. 659, 22-32 (2018).
  25. Fink, A. L. The aggregation and fibrillation of alpha-synuclein. Accounts of Chemical Research. 39, 628-634 (2006).
  26. Diraviyam, K., Stahelin, R. V., Cho, W., Murray, D. Computer modeling of the membrane interaction of FYVE domains. Journal of Molecular Biology. 328, 721-736 (2003).
  27. Van Rooijen, B. D., Claessens, M., Subramaniam, V. Lipid bilayer disruption by oligomeric α-synuclein depends on bilayer charge and accessibility of the hydrophobic core. Biochimica et Biophysica Acta. 1788, 1271-1278 (2009).
  28. Kourie, J. I., Henry, C. L. Ion channel formation and membrane-linked pathologies of misfolded hydrophobic proteins: the role of dangerous unchaperoned molecules. Clinical and Experimental Pharmacology & Physiology. 29, 741-753 (2002).
  29. Bucciantini, M., et al. Inherent toxicity of aggregates implies a common mechanism for protein misfolding diseases. Nature. 416, 507-511 (2002).
  30. Bolognesi, B., et al. ANS binding reveals common features of cytotoxic amyloid species. ACS Chemical Biology. 5, 735-740 (2010).
  31. Posse, E., De Arcuri, B. F., Morero, R. D. Lysozyme interactions with phospholipid vesicles: relationships with fusion and release of aqueous content. Biochimica et Biophysica Acta. 1193, 101-106 (1994).
  32. Roqanian, S., et al. Polyphenols protect mitochondrial membrane against permeabilization induced by HEWL oligomers: possible mechanism of action. International Journal of Biological Macromolecules. 103, 709-720 (2017).
  33. Ulmer, T. S., Bax, A., Cole, N. B., Nussbaum, R. L. Structure and dynamics of micelle-bound human alphasynuclein. The Journal of Biological Chemistry. 280, 9595-9603 (2005).
  34. Stockl, M., Fischer, P., Wanker, E., Herrmann, A. Alpha-synuclein selectively binds to anionic phospholipids embedded in liquid-disordered domains. Journal of Molecular Biology. 375, 1394-1404 (2008).
  35. Devi, L., et al. Mitochondrial import and accumulation of α-synuclein impair complex I in human dopaminergic neuronal cultures and Parkinson disease brain. The Journal of Biological Chemistry. 283, 9089-9100 (2008).
  36. Ghio, S., Kamp, F., Cauchi, R., Giese, A., Vassallo, N. Interaction of α-synuclein with biomembranes in Parkinson’s disease-role of cardiolipin. Progress in Lipid Research. 61, 73-82 (2016).
  37. Petersen, C. A. H., et al. The amyloid β-peptide is imported into mitochondria via the TOM import machinery and localized to mitochondrial cristae. Proceedings of National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 13145-13150 (2008).
  38. Costa, V., Scorrano, L. Shaping the role of mitochondria in the pathogenesis of Huntington’s disease. EMBO Journal. 31, 1853-1864 (2012).
  39. Vande Velde, C., Miller, T. M., Cashman, N. R., Cleveland, D. W. Selective association of misfolded ALS-linked mutant SOD1 with the cytoplasmic face of mitochondria. Proceedings of National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 4022-4027 (2008).
  40. Oladzad Abbasabadi, A., et al. Disruption of mitochondrial membrane integrity induced by amyloid aggregates arising from variants of SOD1. International Journal of Biological Macromolecules. 61, 212-217 (2013).

Play Video

Cite This Article
Zadali, R., Ghareghozloo, E. R., Ramezani, M., Hassani, V., Rafiei, Y., Chiyaneh, S. M., Meratan, A. A. Interactions with and Membrane Permeabilization of Brain Mitochondria by Amyloid Fibrils. J. Vis. Exp. (151), e59883, doi:10.3791/59883 (2019).

View Video