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Um método rápido de alta capacidade para Ribonucleoproteínas Mapping (RNPs) no pré-mRNA Humanos
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A Rapid High-throughput Method for Mapping Ribonucleoproteins (RNPs) on Human pre-mRNA

Um método rápido de alta capacidade para Ribonucleoproteínas Mapping (RNPs) no pré-mRNA Humanos

DOI:
10.3791/1622-v

•

13:00 min

•

December 02, 2009

•

, ,
1Department of Molecular and Cellular Biology,Brown University, 2Center for Computational Molecular Biology,Brown University

Chapters

  • 00:00Title
  • 00:42Introduction
  • 01:17Pool Design and Oligo Recovery
  • 03:53Co-immunoprecipitation of the Oligo Pool with an RNP of Interest
  • 07:50Labeling the Samples and Hybridizations to the Microarray
  • 10:50Mapping RNPs on Pre-mRNAs Representative Results
  • 11:56Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Devido à natureza transitória do pré-mRNA, pode ser difícil isolar e estudar<em> In vivo</em>. Aqui, apresentamos um romance<em> In vitro</em> Abordagem para investigar interações RNA-proteína usando um pool oligo sintéticos que as telhas em regiões selecionadas de pré-mRNA.

Tags

Rapid High-throughput MethodMapping RibonucleoproteinsRNPsHuman Pre-mRNACo-immunoprecipitateRNA Binding ProteinsSplicing FactorIn Vitro ApproachOligonucleotide PoolMolecular SelectionTwo Color Array StrategyEnrichmentHigh-resolution MapsSequence-specific DeterminatesStructural DeterminatesRibonucleoprotein BindingUnique AdvantageSampling BiasIP TechniquesSELEX TechniquesFlexibility

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