Journal
/
Biology
/
Afsløring somatiske genetiske ændringer i tumor Prøver af Exon Capture og Massively Parallel sekventering
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Detecting Somatic Genetic Alterations in Tumor Specimens by Exon Capture and Massively Parallel Sequencing

Afsløring somatiske genetiske ændringer i tumor Prøver af Exon Capture og Massively Parallel sekventering

DOI:
10.3791/50710-v

•

11:02 min

•

October 18, 2013

•

, , , ,
1Department of Pathology,Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, 2Human Oncology and Pathogenesis Program,Memorial Sloan-Kettering Cancer Center

Chapters

  • 00:05Title
  • 02:08Library Preparation: End Repair
  • 04:12Library Preparation: dA-Tailing and Adapter Ligation
  • 05:55Roche Nimblegen SeqCAP EZ Library Hybridization, Wash, and Amplification
  • 08:31Tumor-normal Pair Analysis
  • 10:08Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Vi beskriver fremstillingen af ​​stregkode DNA-biblioteker og efterfølgende hybridisering-baserede exon capture til påvisning af vigtige cancer-associerede mutationer i kliniske tumor prøver af massivt parallelle "næste generation" sekventering. Målrettet exon sekventering tilbyder fordelene ved høj kapacitet, lave omkostninger, og dyb sekvens dækning, hvilket således giver høj følsomhed til at detektere lavfrekvente mutationer.

Tags

Somatic Genetic AlterationsTumor SpecimensExon CaptureMassively Parallel SequencingNext-generation SequencingCancer-associated MutationsSequence MutationsCopy Number AlterationsStructural RearrangementsTargeted Exon SequencingHigh ThroughputLow CostDeep Sequence CoverageHigh Sensitivity

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/50710?article_type=v

CD4+ T-Lymphocyte Capture Using a Disposable Microfluidic Chip for HIV
check_url/50710?article_type=v

Double Whole Mount in situ Hybridization of Early Chick Embryos
check_url/50710?article_type=v

In vivo Reprogramming of Adult Somatic Cells to Pluripotency by Overexpression of Yamanaka Factors
check_url/50710?article_type=v

Effektiv Generation Menneskelige induceret pluripotente stamceller fra humane somatiske celler med Sendai-virus
check_url/50710?article_type=v

Lineær forstærkning Mediated PCR - Lokalisering af genetiske elementer og karakterisering af Ukendt flankerende DNA
check_url/50710?article_type=v

Massively Parallel Reporter Analyser i dyrkede pattedyrceller
check_url/50710?article_type=v

Fækal Glukokortikoid Analyse: Non-invasive Adrenal Overvågning i dyr fra hestefamilien
check_url/50710?article_type=v

Målrettet RNA Sekventering Assay til karakterisere genekspression og Genomisk Alterations
check_url/50710?article_type=v

Samtidig måling af Mitokondriel Calcium og mitokondriemembranen Potentiale i levende celler ved Fluorescent Microscopy
check_url/50710?article_type=v

Interactome-Seq: En protokol til Domainome bibliotek konstruktion, validering og udvælgelse af Phage Display og næste Generation Sequencing

Read Article