Journal
/
Biology
/
Rena Oren: sekvense Metagenomes och Metatranscriptomes från Komplexa Animal-associerade Prover
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
Purifying the Impure: Sequencing Metagenomes and Metatranscriptomes from Complex Animal-associated Samples
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Rena Oren: sekvense Metagenomes och Metatranscriptomes från Komplexa Animal-associerade Prover

DOI:
10.3791/52117-v

•

11:23 min

•

December 22, 2014

•

, , , , ,
1Department of Biology,San Diego State University, 2DOE Joint Genome Institute, 3Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado, 4Department of Pediatrics, School of Medicine,University of Colorado

Chapters

  • 00:05Title
  • 02:01Sample Collection and Pre-treatment
  • 04:11Generating Viral Metagenome and Viral-like Particle Enrichment and Purification
  • 07:12Generating Microbial Metagenome
  • 08:57Results: Generation of Viral and Microbial Metagenomes
  • 10:44Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Använda cystisk fibros luftväg som ett exempel, presenterar manuskriptet en omfattande arbetsflöde innefattar en kombination av metagenomic och metatranscriptomic tillvägagångssätt för att karakterisera den mikrobiella och virala samhällen i djurassocierade prover.

Tags

Keywords: MetagenomicsMetatranscriptomicsHost-associated MicrobiomeCystic FibrosisSputumDNA ExtractionRNA ExtractionHigh-throughput SequencingMicrobial CommunityViral CommunityTaxonomyFunctional Analysis

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/52117?article_type=v

Purifying Plasmid DNA från kolonier Använda Qiagen Miniprep Kit
check_url/52117?article_type=v

Gross Dissection i magen av Hummer, Homarus americanus</em
check_url/52117?article_type=v

En lektin HPLC-metod för att berika selektivt glykosylerat peptider från komplexa biologiska prover
check_url/52117?article_type=v

Kvantifiering av γH2AX foci i vävnadsprover
check_url/52117?article_type=v

Kemiskt blockerad antikropp Microarray för Multiplexade hög kapacitet profilering av specifik proteinglykosylering i komplexa prover
check_url/52117?article_type=v

Detektering av sällsynta genomiska varianter från poolad sekvensering med SPLINTER
check_url/52117?article_type=v

Den MultiBac Protein Complex Production Platform vid EMBL
check_url/52117?article_type=v

Förstärkning, Nästa generations sekvensering, och Genomic DNA Kartläggning av retroviral integration webbplatser
check_url/52117?article_type=v

Riktade RNA Sequencing analys för att karaktärisera Gene Expression och Genomic Ändringar
check_url/52117?article_type=v

Dra membranet nanorör från Giant Unilamellar blåsor

Read Article