Journal
/
Genetics
/
Optimalisatie en Vergelijkende Analyse van Plant Organellaire DNA Verrijkingsmethoden Geschikt voor Volgend Sequencing
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Optimization and Comparative Analysis of Plant Organellar DNA Enrichment Methods Suitable for Next-generation Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Optimalisatie en Vergelijkende Analyse van Plant Organellaire DNA Verrijkingsmethoden Geschikt voor Volgend Sequencing

DOI:
10.3791/55528-v

•

12:33 min

•

July 28, 2017

•

, ,
1Cereal Disease Laboratory,United States Department of Agriculture-Agricultural Research Service, 2Department of Horticultural Science,University of Minnesota, 3Department of Plant Pathology,University of Minnesota

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:49Growing Wheat Plants
  • 01:51Organellar DNA Enrichment by Differential Centrifugation (DC)
  • 07:31Organellar DNA Enrichment by Methyl-fractionation (MF)
  • 09:44Results: Both Enrichment Methods Yield Sufficient DNA Highly Enriched for Organellar Sequences and Suitable for NGS
  • 11:33Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

De vergelijking en optimalisatie van twee organellaire DNA-verrijkingsmethoden worden voorgesteld: traditionele differentiële centrifugatie en fractionering van het totale gDNA op basis van methyleringsstatus. We beoordelen de resulterende DNA-hoeveelheid en kwaliteit, tonen de prestaties aan bij korte-leesvolgorde-sequencing, en bespreken het potentieel voor gebruik bij langlezen single-molecule sequencing.

Tags

Plant OrganelleDNA EnrichmentNext-generation SequencingDifferential CentrifugationMeta FractionationWheat SeedlingOrganelle IsolationSTE BufferFiltration

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/55528?article_type=v

-Methyl-bindende DNA capture Sequencing for Patient Tissues
check_url/55528?article_type=v

Beoordeling van DNA besmetting in RNA Samples gebaseerd op Ribosomal DNA
check_url/55528?article_type=v

Zuivering van hoog molecuulgewicht Genomic DNA van echte meeldauw voor Long-Read Sequencing
check_url/55528?article_type=v

Robuuste DNA isolatie en High-throughput Sequencing bibliotheek bouw voor Herbarium Specimens
check_url/55528?article_type=v

Next-generation Sequencing en Bioinformatics pijpleiding om te evalueren van genetische determinanten van constitutionele ziekte gericht
check_url/55528?article_type=v

Zeldzame gebeurtenis detectie met behulp van fout-gecorrigeerd DNA en RNA Sequencing
check_url/55528?article_type=v

Versterking van in de buurt van Full-length HIV-1 Proviruses voor Next-Generation Sequencing
check_url/55528?article_type=v

High-throughput identificatie van regelgevende gensequenties met behulp van Next-generation Sequencing van circulaire chromosoom conformatie Capture (4C-seq)
check_url/55528?article_type=v

De volgende-generatie van RNA het rangschikken en een bioinformatica pijpleiding om uitgedrukte lijn-1S op het Locus-specific niveau te identificeren
check_url/55528?article_type=v

Single-molecuul Förster Resonance Energy Transfer methoden voor real-time onderzoek van de Holliday Junction-resolutie door GEN1

Read Article