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Volume de Segmentation et analyse des matériaux biologiques à l’aide de Workbench SuRVoS (Super-région Volume Segmentation)
JoVE Journal
Biology
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JoVE Journal Biology
Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS (Super-region Volume Segmentation) Workbench
DOI:

11:38 min

August 23, 2017

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Chapters

  • 00:05Title
  • 00:53Preparing the Workplace, Data Representation, and Generating Appropriate Super-regions
  • 03:19Introduction to Annotation
  • 04:12Segmentation Using Model Training
  • 05:41Segmentation Using Super-regions
  • 06:42Classifiction and Analysis of Data Objects Based on Inherent Characteristics
  • 09:00Results: Model Training, Super-region Segmentation, and Label Splitting Using the SuRVoS Workbench
  • 10:55Conclusion

Summary

Automatic Translation

Segmentation des données tridimensionnelles de nombreuses techniques d’imagerie est un goulot d’étranglement majeur dans l’analyse des systèmes biologiques complexes. Nous décrivons ici l’utilisation de SuRVoS établi à semi-automatiquement segment volumétrique des données diverses échelles de longueur à l’aide d’ensembles de données exemple de tomographie cryo-électronique, cryo tomographie à rayons x mou et techniques de tomographie aux rayons x phase contraste.

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