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Volumen-Segmentierung und Analyse von biologischen Materialien mit SuRVoS (Super-Region Volumen Segmentierung)-Workbench
JoVE Journal
Biology
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JoVE Journal Biology
Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS (Super-region Volume Segmentation) Workbench
DOI:

11:38 min

August 23, 2017

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Chapters

  • 00:05Title
  • 00:53Preparing the Workplace, Data Representation, and Generating Appropriate Super-regions
  • 03:19Introduction to Annotation
  • 04:12Segmentation Using Model Training
  • 05:41Segmentation Using Super-regions
  • 06:42Classifiction and Analysis of Data Objects Based on Inherent Characteristics
  • 09:00Results: Model Training, Super-region Segmentation, and Label Splitting Using the SuRVoS Workbench
  • 10:55Conclusion

Summary

Automatic Translation

Segmentierung der dreidimensionalen Daten aus vielen bildgebenden Verfahren ist ein großer Engpass bei der Analyse komplexer biologischer Systeme. Hier beschreiben wir die Verwendung von SuRVoS Workbench, halbautomatisch Segment volumetrischer Daten auf unterschiedlichen Längenskalen mit Beispiel-Datasets von Cryo-Elektron Tomographie, Cryo weiche Röntgen-Tomographie und Phase Kontrast Röntgen-Tomographie Techniken.

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