Journal
/
Biology
/
Volum segmentering og analyse av biologisk materiale med SuRVoS (super regionen volum segmentering) Workbench
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS (Super-region Volume Segmentation) Workbench

Volum segmentering og analyse av biologisk materiale med SuRVoS (super regionen volum segmentering) Workbench

DOI:
10.3791/56162-v

•

11:38 min

•

August 23, 2017

•

, , , , , , ,
1Science Division, Harwell Science and Innovation Campus,Diamond Light Source, 2School of Computer Science,University of Nottingham

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:53Preparing the Workplace, Data Representation, and Generating Appropriate Super-regions
  • 03:19Introduction to Annotation
  • 04:12Segmentation Using Model Training
  • 05:41Segmentation Using Super-regions
  • 06:42Classifiction and Analysis of Data Objects Based on Inherent Characteristics
  • 09:00Results: Model Training, Super-region Segmentation, and Label Splitting Using the SuRVoS Workbench
  • 10:55Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Segmentering av tredimensjonale data fra mange Bildeteknikker er en alvorlig flaskehals i analyse av komplekse biologiske systemer. Her beskriver vi bruk av SuRVoS Workbench halvautomatisk segmentet volumetriske data i ulike lengde ved hjelp av eksempel datasett fra cryo-elektron tomografi, cryo myk X-ray tomografi og fase kontrast X-ray tomografiske teknikker.

Tags

Volume SegmentationBiological MaterialsSuRVoSSuper-region Volume SegmentationWorkbenchStructural BiologyPhase Contrast X-ray TomographyFeature ChannelsSuper VoxelsAnnotationImage SegmentationData AnalysisMaterial Science

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Large Volume (20L+) Filtration of Coastal Seawater Samples

Small Volume (1-3L) Filtration of Coastal Seawater Samples

Concentration Determination of Nucleic Acids and Proteins Using the Micro-volume Bio-spec Nano Spectrophotometer

Aseptiske laboratorieteknikker: Volume Overføringer med Serologiske Pipettes og Micropipettors

Rekonstruksjon av tre-dimensjonal Histologi Volum og sin søknad til Study Mouse melkekjertler

Cardiac Trykk Volume Loop analyse ved hjelp Conductance katetre i Mus

Måling av trykk Volum Loops i Mus

ACT-PRESTO: biologisk vev Clearing og Immunolabeling Metoder for Volum Imaging

Biologiske utvalg forberedelse av høytrykks fryser, mikrobølgeovn-assistert kontrast ekstrautstyr og Minimal harpiks innebygging volum Imaging

Matrisetomografiarbeidsflyt for målrettet anskaffelse av voluminformasjon ved hjelp av skanningselektronmikroskopi

Read Article