Journal
/
Genetics
/
Informatic analyse van sequencedata van Batch gist 2-Hybrid schermen
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Informatic Analysis of Sequence Data from Batch Yeast 2-Hybrid Screens
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Informatic analyse van sequencedata van Batch gist 2-Hybrid schermen

DOI:
10.3791/57802-v

•

09:14 min

•

June 28, 2018

•

, , ,
1Molecular Physiology and Biophysics,University of Iowa

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:50Mapping Fastq Files
  • 02:14Bioinformatics Processing Using DEEPN Software
  • 06:08Verification of Candidates Identified by DEEPN
  • 08:01Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Diepe sequentiebepaling van gist bevolking geselecteerd voor positieve gist 2-hybrid interacties mogelijk levert een schat aan informatie over interacterende eiwitten van de partner. Hier beschrijven we de werking van specifieke bioinformatica tools en bijgewerkte software voor het analyseren van de reeks gegevens uit dergelijke schermen op maat.

Tags

Informatic AnalysisSequence DataBatch Yeast 2-hybrid ScreensProtein InteractomesBioinformatics ProcessingUser-friendly Graphic User InterfaceMolecular BiologistsCell BiologistsBiochemistsMAPster SoftwareDEEPN AnalysisHISAT2Multi-threadingReference DNA GenomeY2H Prey Library InsertsMapped FilesUnmapped Reads

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/57802?article_type=v

Conjugative Mating Testen voor sequentie-specifieke analyse van Transfer eiwitten die betrokken zijn in bacterieconjugatie
check_url/57802?article_type=v

Transcriptoom analyse<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA Sequencing gegevens via de Tuxedo Suite op de Galaxy Project
check_url/57802?article_type=v

Tweerichtings retrovirale integratie site PCR methodologie en kwantitatieve data analyse werkstroom
check_url/57802?article_type=v

Bereiding van de monsters en de analyse van de RNASeq gebaseerde gen expressie gegevens uit de zebravis
check_url/57802?article_type=v

Één molecuul fluorescentie In Situ hybridisatie (smFISH) analyse in Budding vegetatieve groei van gist en meiose
check_url/57802?article_type=v

Paring gebaseerde overexpressie bibliotheek Screening in het gist
check_url/57802?article_type=v

Nieuwe reeks ontdekking door subtractieve Genomics
check_url/57802?article_type=v

Verbeterde gist One-hybride schermen te identificeren van de transcriptiefactor binden aan menselijke DNA-sequenties
check_url/57802?article_type=v

Sequentie ruimte verkennen om bindende sites te identificeren voor regulatoire RNA-bindende eiwitten
check_url/57802?article_type=v

Gepoolde CRISPR-gebaseerde genetische schermen in zoogdiercellen

Read Article