/

/

Informatic ניתוח של נתוני רצף אצווה שמרים 2-היברידית המסכים

JoVE Journal
Genetics

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Genetics

Informatic Analysis of Sequence Data from Batch Yeast 2-Hybrid Screens

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Informatic ניתוח של נתוני רצף אצווה שמרים 2-היברידית המסכים

DOI:

10.3791/57802-v

•

09:14 min

•

June 28, 2018

•

Venkatramanan Krishnamani, Tabitha A. Peterson, Robert C. Piper, Mark A. Stamnes

¹Molecular Physiology and Biophysics,University of Iowa

Chapters

00:04Title
00:50Mapping Fastq Files
02:14Bioinformatics Processing Using DEEPN Software
06:08Verification of Candidates Identified by DEEPN
08:01Conclusion

Summary

Automatic Translation

רצף עמוק של אוכלוסיות השמרים שנבחר עבור אינטראקציות חיוביות שמרים 2-היברידית פוטנציאל התשואות שפע של מידע אודות אינטראקציה שותף חלבונים. כאן, אנו מתארים את הפעולה של ביואינפורמטיקה ספציפי כלים ותוכנות מעודכן המותאם אישית כדי לנתח נתונים רצף כזה המסכים.

Tags

Informatic Analysis Sequence Data Batch Yeast 2-hybrid Screens Protein Interactomes Bioinformatics Processing User-friendly Graphic User Interface Molecular Biologists Cell Biologists Biochemists MAPster Software DEEPN Analysis HISAT2 Multi-threading Reference DNA Genome Y2H Prey Library Inserts Mapped Files Unmapped Reads

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

מבחני מזווג Conjugative עבור ניתוח רצף ספציפי של חלבוני העברה מעורבים קוניוגציה

Transcriptomic ניתוח<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA רצף נתונים באמצעות Suite טוקסידו על פרויקט גלקסי

דו כיווני Retroviral אינטגרציה אתר PCR מתודולוגיה וניתוח נתונים כמותיים זרימת עבודה

הכנת הדוגמא וניתוח של נתונים ביטוי גנים מבוססת RNASeq דג זברה

קרינה פלואורסצנטית מולקולה בודדת ב באתרו הכלאה (smFISH) ניתוח הנצה גידול וגטטיבי שמרים, מיוזה

ביטוי ההזדווגות מבוססי ספריית הקרנה שמרים

גילוי רצף הרומן מאת גנומיקה מופחתים

מסכי אחד-היברידית משופרת שמרים לזהות גורם שעתוק מחייב את רצפי דנ א אנושי

סיור במרחב הרצף כדי לזהות אתרי כריכה עבור חלבונים כריכת רנ א תקינה

מסכי גנטי מבוססי CRISPR במאגר תאים ממיונקים

Read Article