A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:04Title
- 00:50Mapping Fastq Files
- 02:14Bioinformatics Processing Using DEEPN Software
- 06:08Verification of Candidates Identified by DEEPN
- 08:01Conclusion
Djupsekvensering av jäst populationer valts för positiva jäst 2-hybrid interaktioner potentiellt ger en mängd information om samverkande partner proteiner. Här, beskriver vi driften av specifika bioinformatiska verktyg och anpassade uppdaterad programvara för att analysera sekvensdata från sådana skärmar.
Tags
Informatic AnalysisSequence DataBatch Yeast 2-hybrid ScreensProtein InteractomesBioinformatics ProcessingUser-friendly Graphic User InterfaceMolecular BiologistsCell BiologistsBiochemistsMAPster SoftwareDEEPN AnalysisHISAT2Multi-threadingReference DNA GenomeY2H Prey Library InsertsMapped FilesUnmapped Reads
