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Un metodo per la ricostruzione 3D e l'analisi della realtà virtuale delle cellule gliali e neuronali
JoVE Journal
Neuroscience
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JoVE Journal Neuroscience
A Method for 3D Reconstruction and Virtual Reality Analysis of Glial and Neuronal Cells
DOI:

12:49 min

September 28, 2019

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Chapters

  • 00:04Title
  • 01:02Image Processing Using Fiji
  • 03:58Segmentation (Semi-Automated) and Reconstruction Using Ilastik 1.3.2
  • 07:433D Analysis
  • 09:41Results: 3D Reconstruction and Virtual Reality Analysis
  • 11:40Conclusion

Summary

Automatic Translation

La pipeline descritta è progettata per la segmentazione di set di dati di microscopia elettronica più grandi di gigabyte, per estrarre morfologie intere celle. Una volta che le celle sono state ricostruite in 3D, software personalizzato progettato intorno alle esigenze individuali può essere utilizzato per eseguire un'analisi qualitativa e quantitativa direttamente in 3D, utilizzando anche la realtà virtuale per superare vista occlusione.

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