Journal
/
Genetics
/
משתנה רב-לוקוס-ניתוח חוזר של מספר מחזור של הדג -חיידק הפתוגניים באמצעות מולטיפלקס ואלקטרופורזה קפיסימית
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Multi-locus Variable-number Tandem-repeat Analysis of the Fish-pathogenic Bacterium Yersinia ruckeri by Multiplex PCR and Capillary Electrophoresis
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

משתנה רב-לוקוס-ניתוח חוזר של מספר מחזור של הדג -חיידק הפתוגניים באמצעות מולטיפלקס ואלקטרופורזה קפיסימית

DOI:
10.3791/59455-v

•

10:33 min

•

June 17, 2019

•

, ,
1Fish Health Research Group,Norwegian Veterinary Institute, 2University of Bergen

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:53Bacterial Cultivation and Extraction of Genomic DNA
  • 01:54Multiplex PCR Setup and Cycling Conditions
  • 03:14PCR Amplicon Confirmation by Gel Electrophoresis
  • 04:37Capillary Electrophoresis Setup and Run Conditions
  • 06:06VNTR (Variable-number Tandem-repeat) Size Calling, Repeat Count Calculation and MLVA (Multi-locus Variable-number Tandem-repeat Analysis) Profiling
  • 07:36Minimum Spanning Tree Cluster Analysis of MLVA Data
  • 09:21Results: Gel Electrophoresis, Electropherograms, and Minimum Spanning Tree
  • 10:09Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

הטיפול בדו משתני משתנה מספר לוקוס-repeat (MLVA) המוצג כאן מאפשר מחקר ברזולוציה גבוהה, חזק ונייד של החיידק הפתוגני של הדג. החל מתרבויות טהורות, היישום משתמש ב-PCR מולטיפלקס ובאלקטרופורזה קפילר כדי לייצר פרופילי MLVA 10-הבסים ליישומי מטה.

Tags

Keywords: Yersinia RuckeriMulti-locus Variable-number Tandem-repeat AnalysisMultiplex PCRCapillary ElectrophoresisGenotypingEpidemiologyPopulation StructureDiagnostic SpecificityInfection TracingVirulent ClonesEnvironmental Strains

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/59455?article_type=v

מיזוג במונחים מוחלטים ובאופן יחסי PCR כמותי נתונים לכמת STAT3 אחוי Variant תעתיקים
check_url/59455?article_type=v

באמצעות טכניקה ג'ל אלקטרופורזה פלורסנט PCR-נימי הגנוטיפ קריספר / Cas9 בתיווך נוק מוטאנטים בתוך פורמט תפוקה גבוהה
check_url/59455?article_type=v

ניתוח של C-KIT ליגנד האמרגן באמצעות Immunoprecipitation הכרומטין
check_url/59455?article_type=v

לימוד מחזור גנים ביטוי מוסדר על ידי שני פרוטוקולי סינכרון התא
check_url/59455?article_type=v

דו כיווני Retroviral אינטגרציה אתר PCR מתודולוגיה וניתוח נתונים כמותיים זרימת עבודה
check_url/59455?article_type=v

דיגיטלי PCR מבוססי אינדקס תחרותי עבור ניתוח תפוקה גבוהה של כושר בסלמונלה
check_url/59455?article_type=v

שינוי צורה, הגנום עריכת ופנוהקלדת החנקן-תיקון טרופי קנאביציים עץ Parasponia אנדרסונii
check_url/59455?article_type=v

דיסקציה ומיפוי של התעתיקים הראשוניים והמעובדים בתירס מיטוכונטריון שימוש באסטרטגיה מעגלית-PCR המבוססת על מעגלי
check_url/59455?article_type=v

זיהוי של וירוס הכשל החיסוני האנושי 1 (HIV-1) Antisense חלבון (ASP) תעתיקים בחולים על ידי סטרנד ספציפי-PCR
check_url/59455?article_type=v

אפיון של בידול במבחנה של Keratinocytes האדם העיקרי על ידי ניתוח RNA-Seq

Read Article