Multi-locus Variable-number Tandem-repeat Analysis of the Fish-pathogenic Bacterium <em>Yersinia ruckeri</em> by Multiplex PCR and Capillary Electrophoresis

00:04Title
00:53Bacterial Cultivation and Extraction of Genomic DNA
01:54Multiplex PCR Setup and Cycling Conditions
03:14PCR Amplicon Confirmation by Gel Electrophoresis
04:37Capillary Electrophoresis Setup and Run Conditions
06:06VNTR (Variable-number Tandem-repeat) Size Calling, Repeat Count Calculation and MLVA (Multi-locus Variable-number Tandem-repeat Analysis) Profiling
07:36Minimum Spanning Tree Cluster Analysis of MLVA Data
09:21Results: Gel Electrophoresis, Electropherograms, and Minimum Spanning Tree
10:09Conclusion

Summary

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Il saggio MLVA (Multi-Locus Variable-number tandem-repeat Analysis) qui presentato consente una genotipizzazione ad alta risoluzione poco costosa, robusta e portatile del batterio patogeno del pesce Yersinia ruckeri. Partendo da colture pure, il saggio impiega la PCR multiplex e l'elettroforesi capillare per produrre profili MLVA a dieci loci per applicazioni a valle.

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Determinazione genoma a livello di timing di replicazione del DNA dei mammiferi da contenuti di misura

Usando una tecnica fluorescente PCR-capillare elettroforesi su gel al genotipo CRISPR / Cas9 mediata Knockout Mutants in un formato high-throughput

Analisi del promotore di ligandi di c-KIT utilizzando l'immunoprecipitazione cromatina

Studiare l'espressione del gene regolamentata mediante ciclo cellulare da due protocolli complementari di sincronizzazione delle cellule

Sistema di integrazione bidirezionale retrovirale Metodo PCR e flusso di lavoro analitico dei dati quantitativi

Indice competitivo digitale basato su PCR per l'analisi ad alto epossibilere del fitness nella Salmonella

Trasformazione, editing del genoma e fenotipizzazione dell'azoto-fixing Tropical Cannabaceae Tree Parasponia andersonii

Discriminazione e mappatura delle trascrizioni primarie ed elaborate nel mitocondrio di mais utilizzando una strategia circolare basata su RT-PCR

Rilevamento di trascrizioni di RNA di tipo 1 (HIV-1) di proteina antisenso (ASP) di immunodeficienza umana nei pazienti da parte di RT-PCR specifico di Strand

Multi-locus Numero variabile Tandem-ripetizione Analisi del batterio patogeno del pesce Yersinia ruckeri di Multiplex PCR e elettroforesi capillare

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