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Analyseur de sous-structure : Un flux de travail convivial pour l’exploration rapide et l’analyse précise des corps cellulaires dans les images de microscopie de fluorescence
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Bioengineering
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JoVE Journal Bioengineering
Substructure Analyzer: A User-Friendly Workflow for Rapid Exploration and Accurate Analysis of Cellular Bodies in Fluorescence Microscopy Images
DOI:

14:28 min

July 15, 2020

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Chapters

  • 00:00Introduction
  • 01:06Download Icy and the “Substructure Analyzer” Protocol on Icy Website
  • 01:30Opening the Protocol
  • 02:03Interacting with the Workflow on Icy
  • 02:49Merging of the Channels of an Image
  • 04:57Segmentation of the Regions of Interest
  • 07:42Fluorescent Signal Detection and Analysis
  • 09:25Run the Protocol
  • 10:35Representative Results
  • 13:48Conclusion

Summary

Automatic Translation

Nous présentons un flux de travail librement disponible construit pour l’exploration rapide et l’analyse précise des corps cellulaires dans des compartiments cellulaires spécifiques dans des images de microscopie de fluorescence. Ce flux de travail convivial est conçu sur le logiciel open-source Icy et utilise également les fonctionnalités ImageJ. Le pipeline est abordable sans connaissance dans l’analyse d’image.

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