Journal
/
/
Substructure Analyzer: Ett användarvänligt arbetsflöde för snabb utforskning och korrekt analys av cellulära organ i fluorescensmikroskopi bilder
JoVE Journal
Bioengineering
Author Produced
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Bioengineering
Substructure Analyzer: A User-Friendly Workflow for Rapid Exploration and Accurate Analysis of Cellular Bodies in Fluorescence Microscopy Images
DOI:

14:28 min

July 15, 2020

, , , , , ,

Chapters

  • 00:00Introduction
  • 01:06Download Icy and the “Substructure Analyzer” Protocol on Icy Website
  • 01:30Opening the Protocol
  • 02:03Interacting with the Workflow on Icy
  • 02:49Merging of the Channels of an Image
  • 04:57Segmentation of the Regions of Interest
  • 07:42Fluorescent Signal Detection and Analysis
  • 09:25Run the Protocol
  • 10:35Representative Results
  • 13:48Conclusion

Summary

Automatic Translation

Vi presenterar ett fritt tillgängligt arbetsflöde byggt för snabb utforskning och noggrann analys av cellulära organ i specifika cellfack i fluorescensmikroskopibilder. Detta användarvänliga arbetsflöde är utformat på programvaran med öppen källkod Icy och använder även ImageJ-funktioner. Rörledningen är prisvärd utan kunskap i bildanalys.

Related Videos

Read Article