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Cristalografía de rayos X para estudiar la transición del estado oligomérico de la Thermotoga maritima M42 Aminopeptidasse TmPep1050
JoVE Journal
Biochemistry
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JoVE Journal Biochemistry
X-Ray Crystallography to Study the Oligomeric State Transition of the Thermotoga maritima M42 Aminopeptidase TmPep1050
DOI:

11:27 min

May 13, 2020

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:03Activity Assay
  • 02:19Apoenzyme Preparation
  • 03:32Dimer Preparation
  • 04:03Microseeding
  • 05:01X-Ray Diffraction
  • 05:48Indexation
  • 06:50Molecular Replacement
  • 08:04Model Building
  • 09:07Results: Representative Thermotoga Maritima M42 Aminopeptidase TmPep1050 Oligomeric State Transition
  • 10:50Conclusion

Summary

Automatic Translation

Este protocolo ha sido desarrollado para estudiar la transición dimer-dodecamer de TmPep1050, un M42 aminopeptidasa, a nivel estructural. Es una tubería sencilla que va desde la purificación de proteínas hasta el procesamiento de datos de rayos X. La cristalgénesis, la indexación de conjuntos de datos y el reemplazo molecular se han enfatizado a través de un caso de estudio, la variante TmPep1050H60A H307A.

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