Journal
/
Chemistry
/
Analysera smältning och vätskor från Ab Initio Molecular Dynamics Simulations med UMD-paketet
JoVE Journal
Chemistry
This content is Free Access.
JoVE Journal Chemistry
Analyzing Melts and Fluids from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations with the UMD Package
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Analysera smältning och vätskor från Ab Initio Molecular Dynamics Simulations med UMD-paketet

DOI:
10.3791/61534-v

•

06:37 min

•

September 17, 2021

•

, , , , ,
1Ecole Normale Supérieure de Lyon, Laboratory of Geology of Lyon UMR5276,CNRS, 2Centre for Earth Evolution and Dynamics (CEED),University of Oslo, 3CEA, DAM, DIF

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:24Analysis of the Molecular-dynamics Runs
  • 01:15Perform the Structural Analysis
  • 02:05Perform the Speciation Analysis
  • 02:51Compute Diffusion Coefficients
  • 03:27Time Correlation Functions
  • 04:04Thermodynamic Parameters Stemming from the Simulations
  • 04:29Results: Lifetime of the Si-O Chemical Species
  • 05:59Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Smälter och vätskor är allestädes närvarande vektorer för masstransport i naturliga system. Vi har utvecklat ett paket med öppen källkod för att analysera ab initio molekylär-dynamics simuleringar av sådana system. Vi beräknar strukturella (bindning, klusterisering, kemisk speciation), transport (diffusion, viskositet) och termodynamiska egenskaper (vibrationsspektrum).

Tags

Keywords: Ab Initio Molecular DynamicsUMD PackagePhysical PropertiesChemical PropertiesFluidsPython ScriptsMD SimulationVASPPair Distribution FunctionInteratomic Bond DistancesCoordination PolyhedraPolymerizationMean Square DisplacementSelf-diffusivityDiffusion Coefficients

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/61534?article_type=v

Isolering och kemisk karakterisering av lipid A från gramnegativa bakterier
check_url/61534?article_type=v

Analysera Protein Dynamics Använda Hydrogen Exchange masspektrometri
check_url/61534?article_type=v

Visualisera Lignification Dynamics i anläggningar med Klicka på kemi: dubbel märkning är BLISS!
check_url/61534?article_type=v

Förbränning kemi av bränslen: kvantitativa artbildning uppgifter som erhållits från en atmosfäriska hög temperatur flöde reaktorn med tillsammans molekylär-beam masspektrometer
check_url/61534?article_type=v

Sondera strukturen och dynamiken i gränsskiktspänning vatten med Scanning Tunneling mikroskopi och spektroskopi
check_url/61534?article_type=v

En sluten typ trådlösa Nanopore elektrod för att analysera enstaka nanopartiklar
check_url/61534?article_type=v

Multiscale provtagning av en heterogen vatten/Metal Catalyst gränssnitt som använder täthetsfunktionalteori och kraftfält molekyldynamik
check_url/61534?article_type=v

Utveckla photosensitizer-Kobaloxim hybrider för soldriven H2 produktion i vattenhaltiga aeroba förhållanden
check_url/61534?article_type=v

Vibrational spektra av en N719-Chromophore/Titania Gränssnitt från empirisk-potential molekylär-dynamik simulering, Solvated av en rumstemperatur jonisk vätska

Beräkning av atmosfäriska koncentrationer av molekylära kluster från ab initio termokemi

Read Article