A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:05Introduction
- 01:13Schneiders Line 2 Plus (S2R+) Drosophila Cell Fixation
- 02:02Lysis
- 03:18Enzymatic Digestion, DNA End Biotinylation, and Ligation
- 04:37Crosslink Reversal and DNA Purification
- 05:33Hi-C Template Quality Evaluation
- 06:26Biotin Removal/End Repair and Size Selection
- 07:49Biotin Pulldown/A-Tailing/Adapter Ligation
- 09:33Results: Representative In-Nucleus Hi-C Analysis
- 11:17Conclusion
Genomet er organisert i atomrommet i forskjellige strukturer som kan avsløres gjennom kromosomkonformasjonsfangstteknologier. Hi-C-metoden i kjernen gir en genomomfattende samling av kromatininteraksjoner i Drosophila-cellelinjer, som genererer kontaktkart som kan utforskes med megabaseoppløsning på begrensningsfragmentnivå.
