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Una plataforma de máquina virtual para profesionales no informáticos para usar el aprendizaje profundo para clasificar secuencias biológicas de datos metagenómicos
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JoVE Journal Genetics
A Virtual Machine Platform for Non-Computer Professionals for Using Deep Learning to Classify Biological Sequences of Metagenomic Data
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Una plataforma de máquina virtual para profesionales no informáticos para usar el aprendizaje profundo para clasificar secuencias biológicas de datos metagenómicos

DOI:
10.3791/62250-v

•

09:34 min

•

September 25, 2021

•

,
1Microbiome Medicine Center, Department of Laboratory Medicine, Zhujiang Hospital,Southern Medical University, 2Center for Quantitative Biology,Peking University, 3State Key Laboratory of Organ Failure Research,Southern Medical University

Chapters

  • 00:07Introduction
  • 01:35The Installation of the Virtual Machine
  • 04:11Create Shared Folders and Prepare the Files for the Training Set and Test Set
  • 06:55Digitize the Biological Sequences Using “One‐Shot” Encoding Form
  • 07:27Train and Test the Artificial Neural Network
  • 08:12Result
  • 08:52Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Este tutorial describe un método simple para construir un algoritmo de aprendizaje profundo para realizar la clasificación de secuencias de 2 clases de datos metagenómicos.

Tags

Keywords: Virtual MachineDeep LearningBiological Sequence ClassificationMetagenomic DataSpecies ClassificationGene Function ClassificationHost ClassificationDeep Learning FrameworkSequence ClassificationVirtualBoxUbuntu

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