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Profilo proteomico dell'EPS-Urina attraverso la digestione FASP e l'analisi indipendente dai dati
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Proteomic Profile of EPS-Urine through FASP Digestion and Data-Independent Analysis
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Profilo proteomico dell'EPS-Urina attraverso la digestione FASP e l'analisi indipendente dai dati

DOI:
10.3791/62512-v

•

14:48 min

•

May 08, 2021

•

, , , , , , ,
1Research Centre for Advanced Biochemistry and Molecular Biology, Department of Experimental and Clinical Medicine,Magna Graecia University of Catanzaro, 2Department of Health Science,Magna Graecia University of Catanzaro, 3Romolo Hospital, 4Department of Experimental and Clinical Medicine,Magna Graecia University of Catanzaro

Chapters

  • 00:00Introduction
  • 00:55Protocol
  • 01:25Protocol: FASP Digestion
  • 05:29Protocol: SCX Purification
  • 08:08Protocol: Protein Quantifcation by External Standard
  • 09:23Protocol: NanoLC-MS/MS and DIA Analysis
  • 11:31Protocol: High-pH C18 Fractionation for Spectral Library
  • 13:09Protocol: Data Analysis
  • 13:35Expected Results
  • 13:53Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Qui, presentiamo un protocollo di digestione on-filter ottimizzato con informazioni dettagliate su quanto segue: digestione proteica, purificazione peptidica e analisi di acquisizione indipendente dai dati. Questa strategia viene applicata all'analisi di secrezioni prostatica espresse-campioni di urina e consente un'elevata copertura del proteoma e una profilazione senza etichette a basso valore mancante del proteoma urinario.

Tags

Keywords: Proteomic ProfileEPS-urineFASP DigestionData-independent AnalysisMass SpectrometryBiomarker DiscoveryProstate CancerCentrifugationSample PreparationProtein AlkylationUrea BufferIodoacetamide

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