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Shotgun Proteomics Sample Processing Automated by an Open-Source Lab Robot
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Elaborazione dei campioni di Shotgun Proteomics automatizzata da un robot da laboratorio open source

DOI:
10.3791/63092-v

•

10:12 min

•

October 28, 2021

•

, , , ,
1Department of Medicine-Cardiology,University of Colorado Anschutz Medical Campus, 2Department of Biochemistry & Molecular Genetics,University of Colorado Anschutz Medical Campus, 3Consortium for Fibrosis Research & Translation, School of Medicine,University of Colorado Anschutz Medical Campus

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:40Mass Spectrometry (MS) Sample Preparation with a Single Protein
  • 04:44Peptide Clean-up Using SP3 Paramagnetic Beads
  • 06:19MS Sample Preparation with Protein Lysate
  • 08:37Results: Mass Spectrometry Proteomics with a Single Protein Standard Bovine Serum Albumin and a Detergent-Containing Human Heart Lysate Sample
  • 09:44Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Protocollo dettagliato e tre script Python sono forniti per il funzionamento di un sistema di gestione dei liquidi robotico open source per eseguire la preparazione semi-automatizzata di campioni proteici per esperimenti di spettrometria di massa, che coprono la rimozione del detergente, la digestione delle proteine e le fasi di desalinizzazione dei peptidi.

Tags

Shotgun ProteomicsAutomated Sample ProcessingOpen-source Lab RobotLiquid Handling SystemMass SpectrometryProtein BiochemistryProteomic StudiesAmmonium BicarbonateDTTTemperature ControlAutomationOpen-source Python Scripts

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