A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:04Introduction
- 02:23Conduct Analyses and Generate Visualizations
- 05:17Results: Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Salmonella enterica
- 06:58Conclusion
Denne analytiske beregningsplattformen gir praktisk veiledning for mikrobiologer, økologer og epidemiologer som er interessert i bakteriell populasjonsgenomikk. Nærmere bestemt viste arbeidet som presenteres her hvordan man utfører: i) fylogenistyrt kartlegging av hierarkiske genotyper; ii) frekvensbasert analyse av genotyper; iii) slektskap og klonalitetsanalyser; iv) identifisering av avledningsdifferensiering av tilbehørsloci.
