Journal
/
Genetics
/
Minería heurística de genotipos jerárquicos y loci del genoma accesorio en poblaciones bacterianas
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Bacterial Populations
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Minería heurística de genotipos jerárquicos y loci del genoma accesorio en poblaciones bacterianas

DOI:
10.3791/63115-v

•

08:03 min

•

December 07, 2021

•

, ,
1Department of Computer Science and Engineering,University of Nebraska-Lincoln, 2Department of Food Science and Technology,University of Nebraska-Lincoln, 3Nebraska Food for Health Center,University of Nebraska-Lincoln

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 02:23Conduct Analyses and Generate Visualizations
  • 05:17Results: Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Salmonella enterica
  • 06:58Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Esta plataforma computacional analítica proporciona orientación práctica para microbiólogos, ecólogos y epidemiólogos interesados en la genómica de poblaciones bacterianas. Específicamente, el trabajo presentado aquí demostró cómo realizar: i) mapeo guiado por filogenia de genotipos jerárquicos; ii) análisis de genotipos basado en la frecuencia; iii) análisis de parentesco y clonalidad; iv) identificación del linaje diferenciador de loci accesorios.

Tags

Keywords: Heuristic MiningHierarchical GenotypesAccessory Genome LociBacterial PopulationsProkEvoComputational PlatformScalable AnalysisPan-genomic ContentGenotype MappingPathogenic LineagesPublic Health SurveillanceBacterial Population GenomicsGigi TreePhylogenetic TreeData Aggregation

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/63115?article_type=v

Monitoreo Segregación Espacial en la superficie colonizadores microbianos Poblaciones
check_url/63115?article_type=v

Mapeo de las interacciones RNA-ARN a nivel mundial usando Psoralen Biotinilado
check_url/63115?article_type=v

Determinación de la óptima Localización cromosómica de un elemento de DNA en Escherichia coli utilizando un nuevo enfoque mediada por transposones
check_url/63115?article_type=v

Determinar tasas de decaimiento de transcripción del genoma en quietos y proliferación de fibroblastos humanos
check_url/63115?article_type=v

Mayor genoma edición con Cas9 ribonucleoproteína en diversas células y organismos
check_url/63115?article_type=v

Vigilancia de todo el genoma de errores de transcripción en organismos eucariotas
check_url/63115?article_type=v

Selección de genotipos de algodón para la resistencia de los nematodos reniformes
check_url/63115?article_type=v

Edición del genoma en las líneas celulares de mamíferos utilizando CRISPR-Cas
check_url/63115?article_type=v

HOX Loci enfocado CRISPR/sgRNA biblioteca proyección identificación crítica CTCF límites
check_url/63115?article_type=v

Un protocolo basado en FACS para aislar el ARN de las células secundarias de Drosophila Male Accessory Glands

Read Article