Journal
/
/
Эвристическая добыча иерархических генотипов и локусов генома аксессуаров в бактериальных популяциях
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Bacterial Populations
DOI:

08:03 min

December 07, 2021

, ,

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 02:23Conduct Analyses and Generate Visualizations
  • 05:17Results: Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Salmonella enterica
  • 06:58Conclusion

Summary

Automatic Translation

Эта аналитическая вычислительная платформа предоставляет практическое руководство для микробиологов, экологов и эпидемиологов, заинтересованных в бактериальной популяционной геномике. В частности, представленная здесь работа продемонстрировала, как выполнять: i) филогенное картирование иерархических генотипов; ii) частотный анализ генотипов; iii) анализ родства и клональности; iv) идентификация родословной, дифференцирующей локусы аксессуаров.

Related Videos

Read Article