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単一核RNAシーケンシングのためのマウス交感神経節のバーコード化抗体による低入力核単離および多重化

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Low-input Nucleus Isolation and Multiplexing with Barcoded Antibodies of Mouse Sympathetic Ganglia for Single-nucleus RNA Sequencing

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単一核RNAシーケンシングのためのマウス交感神経節のバーコード化抗体による低入力核単離および多重化

DOI:

10.3791/63397-v

•

10:44 min

•

March 23, 2022

•

Yang Ge², Lieke van Roon, H. Sophia Chen², Ruben Methorst, Martin Paton, Marco C. DeRuiter, Szymon M. Kielbasa, Monique R. M. Jongbloed²

¹Department of Anatomy & Embryology,Leiden University Medical Center, ²Department of Cardiology,Leiden University Medical Center, ³Department of Medical Statistics and Bioinformatics,Leiden University Medical Center

Chapters

00:05Introduction
00:59Dissection of Adult Mouse Superior Cervical Ganglia
02:12Dissection of Adult Mouse Stellate Ganglia
02:57Isolation and Cryopreservation of Mouse Ganglionic Cells
04:56Nucleus Isolation
06:50Nucleus Barcoding with Hashtag Oligos and Multiplexing
08:24Results: Quality Control Analysis of Single-Nucleus cDNA Library Preparation and snRNA-Sequencing
09:55Conclusion

Summary

Automatic Translation

このプロトコルは、マウス上頸部および星状神経節の解剖、細胞解離、凍結保存、核単離、ハッシュタグバーコーディングなど、単一核シーケンシングのための詳細で低入力のサンプル調製について説明しています。

Tags

Keywords: Single-nucleus RNA Sequencing Cardiac Sympathetic Neurons Droplet-based Sequencing Hashtag Oligos Multiplexing Superior Cervical Ganglia Stellate Ganglia Trypsin Digestion

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