Journal
/
Biochemistry
/
Identificatie van RNA-fragmenten als gevolg van enzymatische degradatie met behulp van MALDI-TOF-massaspectrometrie
JoVE Journal
Biochemistry
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biochemistry
Identification of RNA Fragments Resulting from Enzymatic Degradation using MALDI-TOF Mass Spectrometry
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Identificatie van RNA-fragmenten als gevolg van enzymatische degradatie met behulp van MALDI-TOF-massaspectrometrie

DOI:
10.3791/63720-v

•

09:20 min

•

April 11, 2022

•

, , , ,
1Department of Chemistry,University of Colorado, Denver, 2Department of Chemistry & Biochemistry,University of Denver, 3Analytical Resources Core Bioanalysis & Omics,Colorado State University

Chapters

  • 00:09Introduction
  • 01:05Concentration Determination of RNA Solution
  • 03:15Hydrolysis of Oligonucleotides of RNA by Xrn-1
  • 05:31Desalting of RNA Solution, MALDI-TOF Plate Spotting
  • 07:41Results: Identification of Enzymatically Degraded RNA Fragments Using MALDI-TOF Mass Spectrometry
  • 08:32Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

MALDI-TOF werd gebruikt om fragmenten te karakteriseren die werden verkregen uit de reactiviteit tussen geoxideerd RNA en het exoribonuclease Xrn-1. Dit protocol beschrijft een methodiek die toepasbaar is op andere processen waarbij RNA en/of DNA betrokken is.

Tags

RNA FragmentsEnzymatic DegradationMALDI-TOF Mass SpectrometryBiopolymer CharacterizationBiochemical TransformationsUV-Vis SpectrophotometryPeltier Temperature Control

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Tijdsgeresolveerde elektrosprayionisatie waterstof-deuterium Exchange Massaspectrometrie voor het bestuderen van Protein Structure en Dynamics

Het oplossen van Affiniteit gezuiverde eiwit complexen door Blue inheemse PAGE en Protein Correlatie Profiling

Lipide Druppeltje Isolatie kwantitatieve massaspectrometrie Analyse

Bereiding van de monsters voor de massa spectrometrie gebaseerde identificatie van RNA-bindende regio 's

De vaststelling van specificiteit uit Protease in muis weefsel extracten met behulp van de Spectrometrie van de massa van de MALDI-TOF: manipuleren van de PH veroorzaken specificiteit wijzigingen

Proeflezen en DNA Repair Assay met behulp van één Nucleotide uitbreiding en MALDI-TOF massa spectrometrie analyse

Analyseren van de dynamische eiwitcomplexen op gemonteerd en vrijgelaten uit Biolayer interferometrie Biosensor met behulp van spectrometrie van de massa en elektronenmicroscopie

Vastleggen en identificatie van RNA-bindende proteïnen met behulp van klik chemie-bijgewoonde RNA-interactome vangen (CARIC) strategie

Met behulp van de open-source MALDI TOF-MS IDBac pijpleiding voor analyse van microbiële eiwitten en gespecialiseerde metaboliet gegevens

Nitropeptide profilering en identificatie geïllustreerd door angiotensine II

Read Article