Journal
/
Genetics
/
Oreochromis spp. Çiftliklerinden Türetilen Patojenik Bir Escherichia coli Suşunun Karakterizasyonu Tüm Genom Dizilimini Kullanarak
JoVE Journal
Genetics
Author Produced
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Characterization of a Pathogenic Escherichia coli Strain Derived from Oreochromis spp. Farms Using Whole-Genome Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Oreochromis spp. Çiftliklerinden Türetilen Patojenik Bir Escherichia coli Suşunun Karakterizasyonu Tüm Genom Dizilimini Kullanarak

DOI:
10.3791/64404-v

•

09:44 min

•

December 23, 2022

•

, , ,
1Unidad de Investigaciones en Salud Pública “Dra. Kaethe Willms”, Facultad de Ciencias Químico Biológicas,Universidad Autónoma de Sinaloa, 2Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A. C. (CIAD),Unidad Mazatlán en Acuicultura y Manejo Ambiental

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:32DNA Library Preparation
  • 04:15Library Pooling, Denaturalizing, Sequencer Initiating
  • 07:05Sequence Data Analysis
  • 08:07Results: Circular Map and Subsystem Distribution of Draft Genome of E. coli ACM5
  • 09:15Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Masaüstü cihazları kullanan tüm genom dizileme (WGS) stratejilerinin fizibilitesi, laboratuvar ortamında halk sağlığı ile ilgili her mikrobun genom sorgulamasını basitleştirmiştir. Bakteriyel WGS için iş akışının metodolojik bir uyarlaması tanımlanmıştır ve analiz için bir biyoinformatik boru hattı da sunulmuştur.

Tags

Whole-genome SequencingWGSAntimicrobial ResistancePathogenic Escherichia ColiOreochromis Spp. FarmsNext-generation SequencingDNA ExtractionTagmentationIndexingPCRMagnetic Bead Purification

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Tek Hücre sıralama kullanarak Kopya sayısı Değişmeler Algılama

En iyi kromozom Location(s) belirlenmesi için yeni bir Transposon-aracılı yaklaşımın kullanarak Escherichia coli DNA öğesinde

Nesil bir gen kesintiye Streptococcus mutans çoğunlukla zorlanma olmadan Gen Klonlama

Nadiren de olsa algılama hatası düzeltildi DNA ve RNA sıralama

Ultralow giriş genom Kütüphane hazırlık bir tek Tardigrade örnekten sıralama

Amplifikasyon tam uzunlukta HIV-1 Proviruses yakınındaki yeni nesil sıralama için

Gen düzenleyici dizileri dairesel kromozom Conformation yeni nesil sıralama kullanarak yüksek üretilen iş tanımlaması yakalama (4C-seq)

Escherichia coli Excisable antibiyotik direnci kasetleri ile P1 iletim tarafından üreten gen silme

İzole, sıralama ve insan Mezenkimal Kök hücreleri ekstrasellüler mikroRNA'lar analiz

Nanopore sıralamayı kullanarak tüm kan mRNA sıralaması

Read Article