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JoVE Journal
Genetics

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JoVE Journal Genetics
Demonstração do alinhamento da sequência para prever a ferramenta de suscetibilidade entre espécies para avaliação rápida da conservação de proteínas
Studying Cell Cycle-regulated Gene Expression by Two Complementary Cell Synchronization Protocols
Journal (Genetics)
Studying Cell Cycle-regulated Gene Expression by Two Complementary Cell Synchronization Protocols
Genetic Variant Detection in the CALR gene using High Resolution Melting Analysis
Journal (Genetics)
Genetic Variant Detection in the CALR gene using High Resolution Melting Analysis
 
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Demonstração do alinhamento da sequência para prever a ferramenta de suscetibilidade entre espécies para avaliação rápida da conservação de proteínas

Article DOI: 10.3791/63970-v • 16:02 min • February 10th, 2023
February 10th, 2023 •
1, 2, 2, 3, 4, 5, 5, 5, 6
1Office of Research and Development, Center for Computational Toxicology and Exposure, Scientific Computing and Data Curation Division, U.S. Environmental Protection Agency, 2Oak Ridge Institute for Science and Education, 3Swenson College of Science and Engineering, Department of Biology, University of Minnesota Duluth, 4University of Wisconsin-Madison Aquatic Sciences Center, 5General Dynamics Information Technology, Research Triangle Park, 6Office of Research and Development, Center for Computational Toxicology and Exposure, Great Lakes Toxicology and Ecology Division, U.S. Environmental Protection Agency

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Aqui, apresentamos um protocolo para utilizar a versão mais recente da ferramenta Alinhamento de Sequência da Agência de Proteção Ambiental dos EUA para Prever a Suscetibilidade entre Espécies (SeqAPASS). Este protocolo demonstra a aplicação da ferramenta on-line para analisar rapidamente a conservação de proteínas e fornecer previsões personalizáveis e facilmente interpretáveis de suscetibilidade química entre espécies.

Tags

Genética Edição 192 Extrapolação entre espécies ecotoxicologia toxicologia preditiva metodologia de nova abordagem receptor opioide transtirretina
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